Само территориальное управление ФСБ России - ровесник региона как административной единицы. Именно после разделения Уральской области на 3 субъекта было образовано полномочное представительство объединённого главного политического управления (ОГПУ) СССР в Челябинской области. Почти сразу же оно стало управлением НКВД в следствие переименования союзного ведомства.
Челябинское управление имеет богатую историю, которая неразрывно связана с теми эпохальными событиями, что пережил Южный Урал. В предвоенные годы чекисты контролировали возведение стратегических промышленных объектов. С началом Великой Отечественной войны многие сотрудники ушли на фронт, где участвовали в акциях СМЕРШа и особых отделов НКВД. Оставшиеся в области собрали 2,5 миллиона рублей на формирование танковой колонны за что удостоились личной благодарности председателя государственного комитета обороны. В послевоенные годы велика роль сотрудников в создании атомного щита. Это та база опыта, которая помогает нынешнему