Джонс-младший родился 16 января 1969 года в штате Флорида городе Пенсакола. Отец боксера – Рой-старший – был ветераном Вьетнама. После службы он непродолжительное время работал на военно-морской базе близ Пенсаколы, а затем подался в тренеры и открыл свой зал. Глава семейства не понаслышке знал, что такое профессиональный бокс: мужчина всю жизнь провел на ринге. Мать будущей звезды, Кэрол, вела домашнее хозяйство (семья владела маленькой свинофермой).
Рой Джонс старший был суров и востребователен к своему сыну-Джонсу младшему. Часто наказывал его за провинности и заставлял работать на ферме. Рука у большого Роя была тяжёлая, он профессионально занимался боксом, но карьеры сделать не сумел. Однако, он решил, чемпионом должен стать его сын. Уже с раннего возраста отец начал усердно тренировать Джонса младшего. В 1984 году Рой Джонс-младший выиграл юношеские Олимпийские игры, которые проводились в США. А спустя два года ему покорился турнир «Золотые перчатки». В 1986 году Рой проиграл по очкам в полуфинале Игр Доброй Воли советскому боксёру Игорю Ружникову, завоевав бронзу. В 19 лет он участвовал в проходившей в Сеуле Олимпиаде. В 1-м среднем весе Рой легко расправлялся с соперниками. Всего у него насчитывается 66 побед и 9 поражений, из них 47 нокаутов.