Есть большое количество "мифических" данных, о якобы имевшем место просьбе Сталина к молитвенной помощи Церкви, в период ВОВ, но никаких серьёзных документов, которые бы подтверждали это, нет. В трудах православного историка Сергея Фомина «Война, Церковь, Сталин и митрополит Илия » по этому поводу есть, в том числе, некоторая информация:
"Наконец, есть известие, что зимой 1941 г. «изрядно смутившийся Сталин [...] призвал к себе в Кремль духовенство для молебна о даровании победы; тогда же, продолжает легенда, чудотворная Тихвинская икона Богоматери была на самолете обнесена кругом Москвы и Москву от врага спасла. А 9 декабря после первого успешного контрнаступления, предшествовавшего московскому, был освобожден г. Тихвин»."
- Так же в книге говорится, о том, что «в 1942-м самолет с Казанской иконой Богородицы облетел Сталинград — факт, подтвержденый в беседе с писателем Юрием Бондаревым маршал Г. К. Жуков»). Авторы фильма «История России. XX век» упоминают также в блокаду Ленинграда: «Молебны были. Это зафиксировано. Был и облёт Сталинграда с Казанской иконой. Это также подтверждено. И это позволяет обоснованно предположить, что воздушные крестные ходы также состоялись и в Ленинграде, и в Москве». Однако конкретных ссылок на источники, свидетельства очевидцев или архивы, подтверждающие их версию, они не дают.
Изменение политики в отношении Русской православной церкви, со стороны советской власти, вызывают постоянные споры в научной среде. Выдвигаться гипотезы от осознанного использования Сталиным церковных кругов для подчинения себе народа, до предрассудков, что Сталин оставался в душе верующим человеком. Последнее мнение сохранил свое отражение в рассказе Артёма Сергеева, воспитывавшегося в доме Сталина. По мимо этого, по рассказам телохранителя Сталина Юрия Соловьёва, Сталин частенько молился в церкви в Кремле, которая находилась по пути в кинозал. Сам Юрий Соловьёв оставался вне церкви, но мог видеть Сталина через окно. По свидетельству внука Сталина А. В. Бурдонского, Сталин бывало и исповедовался. «Священника трясли уже при правления Никиты Хрущева со страшной силой, но тот ни капли не сказал», — вспоминал Бурдонский. "В некоторых источниках православно-монархического толка называется и имя священнослужителя, по легенде, исповедовавшего Сталина, — митрополит Николай". Православная газета «Вечный зов» приводит свидетельство бывшего секретаря Боржомского райкома партии Д. Ломошвили, который сообщил о разговоре Сталина с матерью, в котором он по её требованию поклялся в том, что «не убивал царя» и перекрестился.
По мнению многих исследователей, реальная подоплёка временного изменения репрессивной политики в отношении Церкви объяснялась соображениям преимущественно политической целесообразности.