В строительных магазинах можно найти восковые мелки для устранения глубоких царапин и сколов. Единственное что нужно знать это, то что заполнив скол или царапину мелком восковым его нужно затереть и покрыть сверху прозрачным лаком.
С маркером все намного проще, если у Вас не глубокая, поверхностная царапина, её можно закрасить вот таким вот маркером. Но так же нужно учитывать что поврежденная поверхность ламинатной доски при попадании влаги может набухнуть и лучше всего нанести слой прозрачного лака во избежание набуханий.