Найти тему

Последнее о Covid-диагностике в России

Оглавление

Особняком от СМИ прошел полезный вебинар с участием ведущих разработчиков отечественных и зарубежных тест систем. Прошел он, правда, в несколько заумном стиле, отчего у журналистской братии, по видимому, не нашлось возможности адаптировать его для масс. А надо бы.

Анализ вирусной РНК (метод ОТ-ПЦР-РВ)

  • Ну во-первых, что отрадно, подтянулось качество отечественных ПЦР-тестов. Если в апреле они ошибались в каждом втором-третьем случае, то сейчас точность полтора-два раза повысилась и составляет около 70-80%.

Почему не выше?

  • Как уже писал ранее (+ см. интервью), и это подтвердилось современными данными: усилилось разнообразие штаммов вируса

Чтобы вам не вникать в заумности научной терминологии скажу человеческим я зыком: почти 80% всех ПЦР-наборов в мире могут испытывать проблемы с выявлением вирусной РНК из-за мощной вариабельности генома вируса

  • Проблема осложняется тем, что большинство ПЦР-наборов, (как у нас, так и в др. странах) создавалось на основе исходного китайского штамма, который претерпел уже значительные изменения.
  • У создателей тест-систем, на самом деле, большая головная боль одновременно: стараться мониторить и вносить корректировки в наборы и при этом не "падать" в скорости выпуска многочисленных партий в условиях дикого потока требуемых анализов.
  • В этом смысле полагаю, что пока вирус не перестанет мутировать, точность останется на том же уровне.

Почему не у всех находят?

  • Есть общепринятый стандарт по тестированию носоглоточного материала
  • Хотя, если брать биопсию из других мест (например, смыв легких или образцы кала), то специфичность существенно выше, чем просто "из носа"
-2

Опять же, транслируя рисунок на обывательский уровень, поясню.

- Всё что по вертикали (циклы) это, грубо выражаясь, простота высоко-точного выявления наличия вирусной РНК. Т.е. в начале заболевания (первые 10 дней) вероятней всего вирус выявляется из образцов носоглотки.

- Из мочи тоже можно, но это лежит за пределами (пунктир) высокой точности (т.е. возможны ложно-положительные).

- На более поздних сроках (>10 дней после появления симптомов) достаточно точно и специфично можно находить вирус и в кале

Совокупно, при удачной организации (что не всегда просто) вирус можно находить у более 80% больных с симптомами, если тестировать вирус из носа, глотки и ЖКТ (см. слайд ниже).
-3

Тестирование антител

Здесь бы отметил три важных момента

Во-первых, опровержение недобросовестной рекламы о том, что антитела видны в первые же дни:

-4
  • Не видны.

Слайд больше для тех, после первых симптомов бежит в лабораторию: рано.

Во-вторых: новый тест на выявление нейтрализующие антитела.

-5
У пациента ищут не просто антитела - маркеры пребывания вируса. а именно такие которые с ним справляются.

В третьих, тесты на антитела тоже могут ошибаться. поскольку кроме Ковида у человека в анамнезе полно и других корона-инфекций (циркулирующих в рамках сезонных ОРВИ)

нужно смотреть на "вилки" под сиреневым S2. Видите, как их много? Узкая вилка - это близкое родство, широкое - дальнее (но тоже родство).
нужно смотреть на "вилки" под сиреневым S2. Видите, как их много? Узкая вилка - это близкое родство, широкое - дальнее (но тоже родство).

Поэтому в ряде случаев, особенно когда видны слабые Ig G, то они вполне могут оказаться признаком более раннего знакомства отнюдь не именно с Ковидом-19.

  • из той же оперы, когда вещают про исчезновение антител, то исчезать могут отнюдь не антитела именно к КВ-19.

-----------------------------------------------------------------------------------------------

Циферки вебинара вполне правдоподобные, хотя встречаются забавные эпизоды, когда производители попинывают конкурентов, по сравнению с которыми в противовес всем проблемам, точность "родных" наборов вдруг добегает выше 90% :))) Скажем, в апреле тот же Г.А. свои собственные наборы оценивал на уровне 70-80%. Поэтому, полагаю, что точность всех производителей в целом как раз сейчас столько и есть. Всё остальное - реклама.