Второй сезон сериала "Сверхъестественное" начинается с больницы, где герои оказываются после аварии.
Дин очнувшись после автокатастрофы, начинает ходить по больнице, обращаться к персоналу, но его ни кто не слышит, после он видит какое то чудовище и ни чего не может понять. Вскоре он натыкается на девушку, которая оказывается "Жнецом смерти" и начинает понимать, что он умирает. Попав в палату к отцу, он видит Сэма рядом с отцом, и в эмоциях сдвигает предмет, Сэм это замечает и понимает, что это Дин по ту сторону. Сэм связывается с Дином с помощью алфавита и выясняет, что дин охотится. Вскоре отец в тайне от них, заключает сделку с Желтоглазым демоном, где Джон Винчестер отдает свою жизнь, за своего сына.
Так начиналась первая серия сезона, вскоре братья продолжили охоту на Желтоглазого. С каждой серией они приближались к цели, встречая на пути разных монстров. Так же на протяжении сезона Сэм и Дин встречают "способных людей" вроде Сэма. Так получалось, что он мог видеть других себе подобных через видения, и находя их, понимал что не все силы других действуют на него. Некоторые оказывались обычными добрыми людьми, некоторые обиженные судьбой хотели наказать этот мир своей силой.
Ближе к финалу, Сэм пропал,и оказался как и другие люди вроде него в заброшенной деревне. Желтоглазый демон собрал всех, для того чтобы они боролись между собой за звание Чемпиона. С начала незнакомцы объединились, пока демон не объяснил в чем суть. Когда все поняли, что нужно делать, началась "Кровавая Баня" остались только двое, Сэм и Джейк Талли(Способен поднимать огромный вес). Сэм победил Джейка в схватке, но не убил, за это он из исподтишка перерезал ему хребет и сбежал, в тот момент когда Дин и Бобби Сингер поспели Сэму на помощь, но было уже поздно.
Сэм умер. В финальной серии Дин нашел "демона перекрестка" с которым заключил сделку "Один год жизни, за жизнь Сэма". После Сэм ожил как ни в чем не бывало, они выяснили для чего им нужен был человек с кровью демона. Все шло к тому, чтобы открыть врата ада, но демоны не могли проникнуть к вратам, так как они были в огромной ловушке(Пентаграмме) построенной из железной дороги Сэмюэлем Кольтом очень давно. Желтоглазый пригрозил Джейку и тот согласился, открыть врата тем самым кольтом, который убивает все сверхъестественное.
В конце когда Джейк открыл врата, сотни демонов вырвались на землю, вместе с Джоном Винчестером,который в последствии и схватил Желтоглазого для того, чтобы Дин мог беспрепятственно выстрелить последним патроном из кольта и пристрелив великое зло, которое прокляло его семью. Так закончился второй сезон сериала в 2007 году.