В 1985 году компания Audi NSU Autounion получила новое название - Audi AG. А уже в сентябре следующего года началось производство новой машины с кузовом 89 с кодом платформы B3.
Так в Европе впервые увидели новое поколение Audi 80 осенью 1986 года, а в остальном мире лишь годом позднее.
Новая модель имела новую аэродинамическую форму и оцинкованный корпус. Это был первый среднеразмерный автомобиль, который имел полностью оцинкованный корпус, что позволяло дольше противостоять коррозии.
На автомобиль устанавливались бензиновые карбюраторные и инжекторные моторы 1.4, 1.6, 1.8 и 2.0 литров и мощностью от 65 до 135 лошадиных сил. К атмосферным дизелям объемом 1.6 и 1.9 литра добавился новый 1.6-литровый 80-сильный турбодизель.
Общее количество выпущенных машин третьего поколения составило 1,62 миллиона. Также на базе Audi 80 были созданы двухдверки Audi Coupe . Модель поставлялась с двигателями 2.0 литра и мощностью 115 лошадиных сил и двумя двигателями 2.3 литра, но разной мощности. Позднее эта модель послужила основой для Audi B4 Coupе и Cabriolet. В названиях этих моделей опустили приставку "80", и они были известны просто, как Audi Coupе и Audi Cabriolet.
Из-за сильной модернизации конструкции в версии кабриолет, эта модель продолжала существовать до 2000 года, ещё долго после того, как модели B3 были заменены версиями на платформе B4.