Для того, чтобы можно было чистить битые ссылки, их, собственно, сначала нужно найти. Для этого выберите любой краулер, например Netpeak Spider или Screaming Frog (это два самых популярных), и сканируйте ваш сайт. Эти программы выявят все страницы, на которые стоит ссылка внутри сайта, а самой этой страницы нет, и поисковик выдает по ним код 404. Таким образом, проверка битых ссылок осуществляется при помощи спайдеров. А чистка производится в зависимости от того, как эта ссылка формируется.
Если она где-то в контенте сайта, например, в случае, когда перелинкованы статьи сайта, то следует просто зайти в каждую из этих статей и вручную удалить или изменить ссылку на другие — живые.
Более подробно в других статьях, которые есть на нашем сайте