Первоначально для атомной бомбардировки Комитетом по выбору целей были отобраны четыре города: Киото, Кокура, Нагасаки и Хиросима. В связи с относительно маломощностью ядерных зарядов, при выборе городов основным был критерий расположения городов на местности - это должна была быть долина, окруженная холмами, при этом создавался эффект фокусирования отраженной волны и разрушения становились еще большими. Кроме этого учитывался такой фактор - все выбранные города были экономически развитыми, имели большое значение в снабжении японской армии и флота.
По итогам заседания из списка целей был исключен город Киото, как представляющий большую историческую ценность . Городу Кокура повезло - в день второй бомбардировки над городом была плотная облачность и американский самолет сбросил бомбу на запасную цель - Нагасаки.
В планах американских военных были еще четыре бомбардировки в сентябре-октябре 1945 года, но своевременная капитуляция Японии предотвратила их.