Барнаульский Свято-Никольский источник в дореволюционные времена был известен не только по Алтайскому краю, но и по всей России. Множество болящих людей приезжали сюда в поисках исцеления и облегчения страданий во время болезни. Источник располагался возле Богородице-Казанского женского монастыря, основанного на безымянной горе Барнаула в 1884 году (ныне здания монастыря заняты СИЗО).
Согласно легенде, название источник получил после явления иконы Николая Чудотворца, которое указало на место, где впоследствии забил ключ. Когда-то источник имел купальню и часовню над ключом. Во времена Гражданской войны возле источника проходили массовые казни горожан Барнаула. Сам источник также подвергся поруганию: безбожная власть старалась скрыть как место своих страшных преступлений, так и в кампанию борьбы с верой. Горы мусора, камней и песка громоздились поверх ключа, но всё это было бесполезно: вода пробивала себе дорогу и делала усилия кощунников тщетными.
Епископ Барнаульский и Алтайский Максим дал благословение на строительство возле источника церкви во имя святого Иакова Барнаульского.