Официально днем рождения липецкой команды мастеров является 2 мая 1957 года. В этот день сильнейшие игроки нашего региона в Липецке сыграли товарищеский матч со сборной Воронежской области.
В 1957-1960 гг. клуб выступал под названием «Трудовые резервы»; с 1961 по 1965 – «Торпедо»; с 1966 г. – «Металлург».
В 1972 году липчане под руководством тренера Виктора Белова стали победителями турнира в 3-й зоне второй лиги, а затем, не потерпев ни одного поражения в финальном турнире (2 победы, 3 ничьи) завоевали путевку в первую лигу.
1973 год стал самым успешным для «Металлурга» в советский период. Поначалу липчан не воспринимали всерьез, и «темная лошадка» первенства по ходу турнира начала обходить признанных фаворитов. «Металлург» находился в лидирующей группе, одерживал одну сенсационную победу за другой. В частности, в гостях металлурги обыграли будущего победителя турнира - одесский «Черноморец» со счетом 1:0. Под конец чемпионата команда немного притормозила и завершила сезон на 5-м месте – наивысший результат липчан в чемпионатах СССР.
В следующем 1974 году «Металлург» не сумел удержать завоеванных позиций и выбыл обратно во вторую лигу. На финише сезона липчане проиграли в Ашхабаде местному «Строителю» - 0:9.
Расплата получилась жесткой: в 1975-1978 гг. команда временно была вынуждена сменить название на «Новолипецк» и лишь с 1979 года вернула прежнее наименование «Металлург».
В 1985/86 годах липчане добились своего лучшего достижения и в Кубке СССР. Чуть ли не весь город пытался попасть на игру «Металлурга» с клубом высшей лиги ереванским «Араратом», в котором хозяева отстояли победу – 1:0 и прошли дальше. Героями той встречи стали мастерски реализовавший штрафной удар Александр Игнатенко и голкипер Олег Лаврушин, вытащивший несколько «мертвых» мячей. Наша команда дошла до четвертьфинала, где весной 1986 г. уступила – 0:3 ленинградскому «Зениту», добившемуся, чтобы матч проходил в городе трех революций в манеже с искусственным полем.
После распада СССР «Металлург» в 1992 году был включен в зону «Запад» первой лиги, а после реформы российского футбола в 1994 г. оказался во втором дивизионе.
Новый успех ждал команду во второй половине 90-х. В 1996 г. собранный лучшим менеджером в истории липецкого футбола Юрием Шишловым состав добился выхода в первый дивизион, а годом позже «сталевары» показали лучший результат в чемпионатах России. Тогда «Металлург», в котором блистали Игорь Меньщиков, Олег Стогов, Милан Ловре, Александр Елисеев и другие, занял 2-е место в первой лиге. Это был единственный случай в истории, когда 2-е место не давало права выхода в высшую лигу (ныне РФПЛ), поскольку из-за очередной реформы российского футбола в 1997 году наверх выходила только одна команда, которой в итоге стал элистинский «Уралан».
Впрочем, все быстро вернулось на круги своя: в 2000 году «Металлург» вернулся во вторую лигу, и на протяжении следующего десятилетия курсировал между вторым и первым дивизионами. Последний раз в первой лиге (ныне ФНЛ) липчане выступали в 2009 году.
С 2010-го команда выступает в зоне «Центр» второго дивизиона, за это время дважды заняв 4-е место. Но липецкие любители футбола верят, что вернутся былые славные времена.
Лучший бомбардир в истории «Металлурга» – Николай Егоров (89 мячей с учетом Кубка России). Больше всего матчей сыграл Николай Анненков – 370. По 12 сезонов провели в команде Николай Анненков, Олег Лизнев, Олег Лаврушин.
Знаменитые футболисты, выступавшие в «Металлурге»: Борис Разинский (олимпийский чемпион 1956 г.), Игорь Скляров (олимпийский чемпион 1988 г.), Виктор Панченко (лучший бомбардир чемпионата России 1993 г.), Дмитрий Быстров (чемпион СССР 1991 г.), Сергей Филиппенков, Евгений Долгов, Геннадий Гришин, Виктор Кукин, Геннадий Коркин, Игорь Меньщиков, Олег Стогов, Сергей Налалушко, Александр Жидков, Сергей Полястянов, Валерий Жабко, Милан Ловре (Сербия), Александр Елисеев, Валентин Лобанев (оба – Латвия), Валерий Саморуков, Андрей Мананников, Дмитрий Акимов, Александр Петухов, Зураб Саная, Денис Угаров, Максим Аристархов, Михаил Юдин, Рафаэль Зангионов, Олег Касторный, Александр Мартюк (Украина), Дмитрий Алексеев, Михаил Бесчастных, Андрей Овчинников.