Уфологическая литература содержит множество описаний, связанных с анатомией предполагаемых инопланетян. Прежде всего ошеломляет необычайное разнообразие форм, в которых они являлись на глаза жителей Земли. По анатомическим признакам все пришельцы могут быть разделены на две большие категории — гуманоидов и негуманоидов, но следует иметь в виду, что эти категории условны и во многом перекрываются.
Обычно гуманоиды описываются как двуногие существа, у которых из торса исходят верхние и нижние конечности, в целом похожие на человеческие, и голова. При этом далеко не всегда голова может быть отчётливо выделена, а верхние конечности могут иметь вид скорее крыльев, чем рук. Шея может присутствовать или отсутствовать. Кисти рук иногда напоминают обычные человеческие, однако во многих описаниях фигурируют лапы с когтями и даже крошечные присоски на кончиках пальцев. Иногда очевидцам «удавалось» разглядеть у пришельцев разного рода механические приспособления вместо кистей рук. Ноги могут быть совершенно неотличимы от человеческих конечностей, хотя иногда производят впечатление негнущихся. В рассказах некоторых участников встреч с предполагаемыми гостями из космоса сообщаются внешние признаки, в большей степени ассоциирующиеся в нашем представлении с детьми, это и малый рост, и непропорционально крупный череп, и внешне хилые конечности (так называемые неотенические черты).
Далеко не всегда ступни инопланетян описываются достаточно подробно, хотя и здесь можно отметить широкое разнообразие форм — от простых дисков, до подобия человеческих ступней, но полностью плоских. В качестве доказательств встреч с пришельцами нередко предъявлялись слепки отпечатков ног якобы внеземных существ (это делал, к примеру, известный американский контактёр Джордж Адамски), однако вряд ли их можно всерьёз рассматривать как надёжные свидетельства.
Во многих описаниях наши предполагаемые братья по разуму предстают как чрезвычайно волосатые существа, однако в последние полвека наблюдается иная тенденция: чаще отмечается безволосость пришельцев (ещё один предположительно неотенический признак). Другим характерным внешним признаком, довольно чачто упоминающимся в описаниях такого рода, может считаться исключительно бледная или даже серебристая кожа. Некоторые очевидцы заявляли, что кожа инопланетян чрезвычайно прочна и способна даже отражать пули без видимого для себя ущерба.
Черты лица у существ из НЛО в целом напоминают человеческие, но могут отличаться в ряде деталей. Типичного инопланетянина описывают следующим образом: два глаза на лице, нос (или, по крайней мере, ноздри), рот, часто маленький и лишённый губ. Иногда на голове расположены уши или же виднеются простые отверстия в тех местах, где у человека расположены органы слуха. Глаза, как правило, очень велики, если исходить из привычных для нас стандартов, и могут быть либо чёрного цвета, либо иметь вертикальные зрачки-щёлки (как у кошек). Они могут светиться в темноте и даже, если верить некоторым рассказчикам, оказывать парализующий эффект на наблюдателей. Иногда в описаниях упоминается третий глаз или же какая-то похожая структура в центре лба.
Весьма любопытная страница уфологической литературы связана с аутопсией, якобы выполнявшейся на телах инопланетян, которые, как утверждалось, были найдены после крушения космического корабля пришельцев над одной из пустынь на юго-западе США. Эти слухи ничем не подкреплены и во многих деталях противоречивы. Так, согласно одной из версий, внутренняя анатомия инопланетян оказалась весьма схожей с человеческой. По другой версии, у пришельцев практически отсутствовала пищеварительная система, хотя в прочем они действительно напоминали обычных людей.
По некоторым свидетельствам, инопланетяне имели «гибридные» черты, то есть частично они походили на землян и в то же время обладали совершенно необычными внешними признаками. Утверждалось, что такая внешность — результат генной инженерии. Большинство уфологов склонны считать такие рассказы или вымыслом, или плодом фантазии, или же галлюцинациями. Те свидетельства, которые предъявлялись в поддержку гипотезы о генной инженерии применительно к землянам (фотоснимки и т. д.) не выдержали серьёзной проверки.
Что касается инопланетян с отчётливо негуманоидными чертами, то они описывались похожими на рептилий, амфибий, птиц, насекомых, даже роботов, хотя в большинстве случаев их также наделяли двумя нижними конечностями, с помощью которых они якобы передвигались. Анатомия этих существ также более чем разнообразна. В частности, кожа может иметь самые разные оттенки и строение (от совершенно гладкой до покрытой чешуйками). Уфологи отмечают следующий факт: большинство из тех, кому якобы довелось встречаться с инопланетянами-негуманоидами, были убеждены в том, что, несмотря на необычный облик, анатомия этих существ, предположительно прибывших на Землю из далёких звёздных систем, в целом схожа с анатомией многих организмов на нашей планете. По мнению скептиков, такое «совпадение» позволяет сделать только один вывод: все эти пришельцы — суть плод воображения людей, и все отличия в их внешнем облике объясняются лишь разницей в фантазиях «очевидцев».