Анализируя геномы вируса от более чем 7500 человек, инфицированных Covid-19, исследовательская группа института генетики охарактеризовала разнообразные модели генома вируса SARS-CoV-2, предлагая направления для разработки лекарств и вакцин.
Отличие COVID-19 от SARS-CoV-2
Для медиков этот вопрос выглядит смешным, но не каждый читатель найдет на него ответ, поэтому для начала пару слов о терминологии.
SARS-CoV-2 - это непосредственный возбудитель инфекции. Имеет также второе название: 2019-nCoV, так как впервые выявлен в 2019 году в Ухане (Китай). SARS-CoV-2 полностью расшифровывается как Severe Аcute Respiratory Syndrome CoronaVirus и переводится как "тяжелый острый респираторный синдром, вызванный коронавирусом". Наверно из-за перевода стали путать название самого возбудителя с заболеванием.
COVID-19 - это название инфекционного заболевания, оно же - коронавирусная инфекция.
Много научных знаний
Исследователи обнаружили, что значительная доля глобального генетического разнообразия SARS-CoV-2 обнаружена во всех наиболее пострадавших странах, что означает широкое распространение вируса с самого начала эпидемии и отсутствие "первичного носителя" в большинстве стран.
Результаты, опубликованные в Infection, Genetics and Evolution, также подтверждают, что вирус появился только недавно в конце 2019 года, прежде чем быстро распространился по всему миру. Ученые проанализировали появление геномного разнообразия SARS-CoV-2, в новом коронавирусе, путем скрининга генетических спиралей 7500 вирусов от инфицированных пациентов по всему миру. Они определили 198 мутаций, которые, по-видимому, независимо рождались более одного раза, что может помочь понять, как вирус адаптируется.
Профессор Франсуа Баллу (UCL Genetics Institute), разъясняет: "Все вирусы мутируют естественным образом. Мутации сами по себе не являются чем то особенным, и нет никаких оснований предполагать, что SARS-CoV-2 мутирует быстрее или медленнее, чем ожидалось. До сих пор мы не можем сказать, становится ли SARS-CoV-2 более или менее смертельным и заразным".
Выявленные небольшие генетические изменения и мутации не были равномерно распределены по геному вируса. Поскольку некоторые части генома имели очень мало мутаций, исследователи утверждают, что эти инвариантные части вируса могут быть лучшими мишенями для разработки лекарств и вакцин.
"Основная проблема для победы над вирусами заключается в том, что вакцина или лекарство могут перестать быть эффективными, если вирус снова мутирует. Мы должны сосредоточить наши усилия на тех частях вируса, которые изменятся с меньшей вероятностью, у нас будет больше шансов разработать эффективные лекарства в долгосрочной перспективе", объяснил профессор Баллу. Необходимо создать лекарства и вакцины, которые вирус не смог бы "обойти".
Доктор Люси ван Дорп (UCL Genetics Institute) добавила: «Все еще очень мало генетических различий или мутаций между вирусами. Было обнаружено, что некоторые из этих различий возникали многократно, независимо друг от друга в ходе пандемии, мы должны продолжать следить за ними по мере появления новых геномов и проводить исследования, чтобы точно понять, как это происходит».
Полученные результаты дополняют растущее количество свидетельств того, что вирусы SARS-CoV-2 имеют общего предка с конца 2019 года, такое могло произойти, когда вирус перепрыгнул с предыдущего животного - хозяина на человека. Прежде всего это означает, что вирус, вызывающий COVID-19, находился в человеческом кровообращении еще до того, как был впервые обнаружен.
Во многих странах, в том числе и в Великобритании, выборка вирусов была почти такой же, как и во всем мире, то есть вирус попадал в Великобританию много раз независимо, а не через какой-либо один конкретный канал.
Исследовательская группа разработала новое интерактивное online - приложение с открытым исходным кодом, чтобы исследователи по всему миру могли также просматривать геномы вируса и применять аналогичные подходы, чтобы лучше понять его эволюцию.
Д-р ван Дорп сказала: «Возможность анализировать такое необычайное количество вирусных геномов в течение первых нескольких месяцев пандемии может иметь неоценимое значение для усилий по разработке лекарств и демонстрирует, насколько далеко продвинулись геномные исследования даже за последнее десятилетие. Мы все имеем большой пласт научной информации благодаря огромным усилиям сотен исследователей во всем мире, которые занимаются изучением вирусных геномов и делают их доступными в Интернете».
Исследование проводилось учеными факультетов естественных наук и медицинских наук UCL, а также коллегами из Cirad и Université de la Reunion, Оксфордского университета и Имперского колледжа Лондона.
Рерайтинг материалов "Mutations in SARS-CoV-2 offer insights into virus evolution". Перевод Д.Кац
Иллюстрации взяты из открытых источников