Потому что военная тайна.
Во-первых, так уж принято, для стрельбы нужен ствол. Ствол у тополя вполне себе. Собственно, изначально орудийный ствол и делали из ствола дерева, правда, вишневого, моё почтение барону Мюнхгаузену.
Во-вторых, на латыни тополь это populus. Отличное слово, прекрасно характеризующее последствия применения ракетного комплекса как полный populus. Я б назвал ракету тополем уже только за это.
Но ракетный комплекс называется Тополем вовсе не поэтому.
В действительности же культурные люди не опускаются до угроз разбить кого-нибудь в пух и прах, они просто шутят про тополя.