Вечный
Во время охоты на преступника Хаша, нанятого для участия в замысле истинного вдохновителя, Бэтмен впервые - хотя и косвенно - встретился со Спойлером, который использовал его, чтобы спастись от наёмного убийцы Эдуардо Фламинго, который охотился за ней, потому что она знала что-то о тайне нападения на Готэм.
Ещё одной частью заговора по изнурению Бэтмена было воскрешение злого вождя культа Дикона Блэкфайра в Аркхеме, но этот план был (в основном) сорван Бэтменом и Джимом Корриганом. Однако при этом здание Аркхемской психушки было разрушено, освободив заключенных в Готэме. Когда Бэтмену, наконец, удалось поймать Хаша - было уже слишком поздно - Бэтмен так долго отвлекался, что настоящий проводник полностью обчистил все тайники гаджетов Бэтмена и продал их его врагам. Пока Бэтмен ещё искал, кто стоит за этим сложным заговором, он нацелился на Ра'с аль Гула.
После того, как Брюс обнаружил, что в то время, как он отвлекался на поиски зацепок, город был в огне, а его инфраструктура была обращена против горожан - он, наконец, получил приглашение вернуться в Beacon Tower, чтобы посмотреть на конец всего, что его волнует. Однако, несмотря на все насмешки и объяснения Клумастера о том, как он использовал хитроумную схему для охоты на Брюса - он был неожиданно убит тем, кто действительно стоял за всем этим - Линкольном Марше - человеком, который считает себя младшим братом Брюса. В их битве Брюс оказался слишком слаб для борьбы, но получил подкрепление, когда Джим Гордон призвал весь город взять на себя роль Бэтмена и стать героями - ради их собственного города. Вскоре союзники Бэтмена сплотились вокруг него, и именно Спойлер сбила Марша - хотя он и сбежал в канализацию, чтобы быть пойманным уже Совиным Судом.
После разрушения Аркхемской психушки - Бэтмен разрешил поместью Уэйна стать временным домом для заключённых, и даже отправился в новое убежище под прикрытием мертвеца Джека Шоу, чтобы расследовать серию убийств. Несмотря на разгадку тайны и имея возможность вернуть свой дом, Брюс позволил городу сохранить имение до тех пор, пока они не смогли возвести постоянную замену после недавнего нападения на Готэм.
Возрождение Робина
В конце концов, Бэтмен решил начать поиски Рас Аль Гула и украденных тел Дэмиана и Талии. Когда Бэтмен, наконец, выследил Раса и успешно победил его, саркофаг Дэмиана был украден славным Годфри и увезён обратно в Апоколипс. Игнорируя инакомыслие Лиги, он пробрался на Сателлит, чтобы украсть специализированный Бэт-костюм, призванный помочь ему выжить против угрозы со стороны Апокалипса. В то время как Бэтмен сражался на Апокалипсе на пути к Годфри - его семья решила, что они не позволят ему сражаться в одиночку, и похитили Киборга, заставив его открыть Бум-Тьюб, который доставит их также и к Апокалипсу. Перед тем, как они ушли - Альфред дал каждому из них новый костюм, напоминающий костюм Робина, чтобы напомнить, за кого они сражались.
После допроса Годфри - Бэтмен объединился со своими союзниками и узнал, что сын Дарксайда, Калибак, использовал мощный камень, известный как Кристалл Хаоса и саркофаг Дэмиана, чтобы привести в действие оружие, называемое Пушка Хаоса, которое может уничтожить целую Луну.
Приезд Бэтмена на Апоколипс взбудоражил даже самого Дарксайда, который бросил вызов решительному отцу. Добравшись до тела Дэмиана, Бэтмен вонзил заряженный осколок Кристалла Хаоса в грудь Дэмиана и воскресил его. Спасаясь от мира Дарксайда через Бум Тьюб, именно тогда они обнаружили, что воскрешение Дэмиана от данного артефакта дало ему сверхчеловеческие способности, которые через некоторое время ослабли.
Конец игры
В то время как Бэтмен восстанавливался после нападения Пугала, на него напала Лига Справедливости Джокера, дав понять, что Джокер наконец-то вернулся. После подчинения Лиги Справедливости - Бэтмен узнал, что новейшим врачом в Аркхемской Психушке - Эриком Границей - на самом деле все это время был Джокер. Сумасшедший, наконец скинув маскировку перед героем - активировал в Готэме токсин, который сделал всех его граждан Джокерами.
Продолжение всё ещё следует...