Найти в Дзене
Programming

Новое применение визуализации освещает процессы в раке, COVID-19

Резюме: Медицинские изображения для широкого спектра заболеваний, включая COVID-19, теперь можно легче просматривать, сравнивать и анализировать с помощью революционной веб-платформы визуализации, разработанной Массачусетской общей больницей (Massachusetts General Hospital(MGH)) и сотрудничающими с ней исследователями. Веб-обозреватель Open Health Imaging Foundation (OHIF) был изначально разработан при грантовой поддержке программы Информационные технологии для исследования рака Национального института рака (NCI-ITCR) для использования в исследованиях и клинических испытаниях по созданию изображений рака, где она уже принята несколькими лидерами в этой области. Тем не менее, OHIF Viewer и лежащие в его основе краеугольные библиотеки и инструменты также могут быть использованы при любом заболевании и все чаще используются для проектов COVID-19. "Этот обозреватель обеспечивает производительность, которую вы обычно получаете только от установленного приложения [программного обеспечения]

Резюме:

Медицинские изображения для широкого спектра заболеваний, включая COVID-19, теперь можно легче просматривать, сравнивать и анализировать с помощью революционной веб-платформы визуализации, разработанной Массачусетской общей больницей (Massachusetts General Hospital(MGH)) и сотрудничающими с ней исследователями.

https://cdn.pixabay.com/photo/2013/11/20/18/33/heart-214011__340.jpg
https://cdn.pixabay.com/photo/2013/11/20/18/33/heart-214011__340.jpg

Веб-обозреватель Open Health Imaging Foundation (OHIF) был изначально разработан при грантовой поддержке программы Информационные технологии для исследования рака Национального института рака (NCI-ITCR) для использования в исследованиях и клинических испытаниях по созданию изображений рака, где она уже принята несколькими лидерами в этой области. Тем не менее, OHIF Viewer и лежащие в его основе краеугольные библиотеки и инструменты также могут быть использованы при любом заболевании и все чаще используются для проектов COVID-19.

"Этот обозреватель обеспечивает производительность, которую вы обычно получаете только от установленного приложения [программного обеспечения], но мы делаем это через веб-браузер", - говорит Гордон Харрис (Gordon J. Harris), доктор философии, автор статьи об этом зрителе в журнале Journal of Clinical Oncology (Клинико-онкологическая информатика) "Это бесплатная, расширяемая платформа с открытым исходным кодом, которая уже используется в проектах по всему миру".

Доктор Харрис является директором службы 3D-изображений в MGH и профессором радиологии в Гарвардской медицинской школе. OHIF был основан в 2015 году и возглавляется командой, включающей доктора Харриса и соавторов - Криса Хаффи, Роба Льюиса, Стива Пайпера, Тринити Урбан и Эрика Зиглера.

Эта и без того популярная бесплатная программа совместима, имеет коммерческий класс, удобна в использовании и требует меньше технической поддержки, чем обычный коммерческий продукт. Программное обеспечение является "нулевым следом", это означает, что оно может быть запущено в веб-браузере с любого компьютера без загрузки программного обеспечения. Она может быть запущена с веб-сервера на локальном компьютере или в облаке. Пользователь также может получить доступ к нему из нескольких мест.

Кроме того, исследователи могут свободно загружать, изменять и вносить свой вклад в исходный код программы (http://www.ohif.org; http://www.cornerstonejs.org). В целом, платформа была загружена более 8500 раз и переведена на несколько языков.

В качестве примера можно привести три проекта, использующих OHIF Viewer и/или лежащие в его основе библиотеки Cornerstone для приложений визуализации COVID-19:

  • Из Австралии платформа виртуальной клинической среды DetectED-X CovED обеспечивает обучение рентгенологов всего мира по вопросам появления КТ-сканирования на КТ-изображениях КОВИД-19;
  • Из Южной Кореи - программы VUNO Med LungQuant и VUNO Med Chest Рентгеновский искусственный интеллект (ИИ) для диагностики КОВИД-19;
  • Из Германии и Бразилии - Nextcloud DICOM Viewer - открытая, безопасная, быстрая, облачная и простая веб-система просмотра медицинских изображений, используемая для диагностики COVID-19 с сайтов по всей Бразилии, где она обеспечивает безопасную и быструю диагностику.
  • Все эти приложения предоставляются бесплатно для поддержки усилий по борьбе с этой пандемией во всем мире.

Тем временем, OHIF Viewer стал опорой для элитного набора онкологических центров благодаря программе Precision Imaging Metrics, разработанной в MGH и онкологическом центре Дана-Фарбера/Гарварда. Пользователи этой программы выполняют более 25 000 оценок онкологических изображений в год для более чем 1000 активных клинических испытаний с использованием Precision Imaging Metrics. NCI назначил онкологических центров, которые являются членами и используют эту платформу для клинических испытаний изображений информатики включают:

  • Дана-Фарбер/Гарвардский онкологический центр;
  • Йельский онкологический центр;
  • Исследовательский центр рака Фреда Хатчинсона при Вашингтонском университете;
  • Институт рака Хантсмана при Университете штата Юта;
  • Институт рака Уиншип в Университете Эмори;
  • Раковый центр Масси в Университете Содружества Вирджинии;
  • Медицинский колледж Висконсина;
  • Раковый центр Карманос в Университете штата Уэйн;
  • Общегосударственная детская больница (начало деятельности в 2020 году);

"Многие академические и промышленные проекты также используют платформу OHIF и связанные с ней инструменты Cornerstone для разработки новых веб-приложений для работы с изображениями, и компании, занимающиеся обучением машинному оборудованию, также подключаются к ней. Мы слышим только о небольшой части компаний, которые используют эту платформу, так как ее можно бесплатно скачать и настроить. Сотни разработчиков программного обеспечения по всему миру переняли нашу платформу, и мы приветствуем вклад сообщества пользователей", - говорит Харрис.