Акции фирмы упали в этом месяце после того, как выяснилось, что она обнаружила 310 миллионов долларов (250 миллионов фунтов) в поддельных сделках.
Luckin пообещал обогнать Starbucks, как крупнейшую китайскую сеть кофеен, когда он запустил акции в США в прошлом году.
Листинг Nasdaq был одним из немногих успешных дебютов на фондовом рынке Китая в 2019 году.
Luckin Coffee подтвердил на своем официальном счете в Weibo, что его проверяет Государственная администрация по регулированию рынка (SAMR).
Компания также заявила, что она «активно сотрудничает» с зондом, и что ее магазины остаются открытыми по всей стране.
Luckin Coffee не сразу ответила на запрос BBC о дальнейших комментариях.
Китайская комиссия по регулированию ценных бумаг уже проводит собственное расследование по делу Luckin.
Ранее в этом месяце Luckin заявил, что временно отстранил своего главного операционного директора Jian Liu и сотрудников, подчиняющихся ему.
Лукин сказал, что расследование показало, что сфабрикованные продажи со второго квартала прошлого года до четвертого квартала составили около 40% от его предполагаемых годовых продаж.
По состоянию на конец сентября сеть кофеен насчитывала 3680 магазинов, согласно отчету о доходах за третий квартал 2019 года. Это представляет почти шестикратный рост с июня 2018 года.
Эти цифры роста помогли компании увеличить стоимость акций на американском рынке почти втрое с момента ее дебюта в Нью-Йорке в мае.
Доля фирмы была приостановлена из торговли 7 апреля. Биржа Nasdaq заявила, что акции останутся приостановленными до тех пор, пока Luckin полностью не удовлетворит свой запрос о дополнительной информации.
Бухгалтерский скандал в Luckin рассматривается как затуманивающий перспективы для других китайских компаний, рассматривающих возможность продажи акций в США.