К концу первой декады 21 века, в декабре 2019 года, в г. Ухань, провинция Хубэй (Китай), появились многочисленные случаи пневмонии с неустановленной причиной, клиническая картина которых во многом напоминала грипп и вирусную пневмонию. После выделения вируса и анализа последовательности вирусных геномов из образцов инфицированного пациента, из неизвестного источника был обнаружен новый коронавирус, названный коронавирусом 2 или SARS-CoV-2 (первоначально названный новым коронавирусом или nCoV-2019), связанным с тяжелым острым респираторным синдромом. SARS-CoV-2 является возбудителем респираторных заболеваний, который Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) недавно назвала коронавирусной болезнью 2019 года (COVID-19). Передача SARS-CoV-2 от человека к человеку является серьезной проблемой для работников здравоохранения, и предварительный показатель R0 (Reproductive number: as the number of new infection one infected person generated on average across its infectious period), равный 1,4-2,5, был зарегистрирован ВОЗ. С момента ее появления в течение месяца накапливается огромное количество новых случаев, и фактическое значение R0 может быть значительно выше, чем было рассчитано ранее. Эпидемиологические данные свидетельствуют о том, что приблизительно (по состоянию на 29 февраля 2020 г.) 79 251 человек заразились этим вирусом на материковой части Китая, а также о многочисленных случаях заболевания, о которых также сообщалось из других частей мира. Нынешние данные показывают, что различные подтипы коронавирусов находятся в циркуляции в популяции летучих мышей, включая другие виды, такие как птицы, кошки, собаки, свиньи, мыши, лошади, киты, до того, как они приобретут способность преодолевать видовые барьеры, чтобы вызвать инфицирование человека. До сих пор остается без ответа, каким образом атипичная пневмония (SARS-CoV-2) вызвала вспышку в Ухане. Первоначальная волна инфекции, обнаруженная на рынке морепродуктов в Вухань, усиливает гипотезу о том, что тесный контакт живого или мертвого животного с индивидуумом может быть причиной возникновения вспышки. Способность к распространению среди людей при тесном контакте делает SARS-CoV-2 очень важным инфекционным агентом для изучения и мониторинга, разрушение которого уже установлено в Вухань, Хубэй, Китай.
Одной из самых тревожных вещей при любой вспышке является распространение вирусов от людей с легкой или бессимптомной формой заболевания, что, вероятно, происходит в случае заражения SARS-CoV-2. Если эта тенденция продолжится, то вирус может закрепиться в населении, и карантин будет очень трудно остановить распространение вируса. Филогенетический анализ, проведенный в данном исследовании на основе последовательности нуклеотидов гена Spike, показал, что все последовательности SARS-CoV-2 образуют единый кластер без каких-либо разветвлений, свидетельствующих о сохранении SARS-CoV-2 на протяжении всей этой продолжающейся вспышки. Более ранние исследования показали, что шипованный белок был мишенью надежного гуморального иммунного ответа в случае вирусной инфекции ТОРС или МЕРС. Эти данные свидетельствуют о том, что вирус, вызвавший первоначальную вспышку атипичной пневмонии (SARS-CoV-2), все еще находится в циркуляции без каких-либо серьезных изменений. Очень малое количество или отсутствие ранее существовавшего иммунитета в обществе или селекционное давление в популяции, вероятно, позволили вирусу SARS-CoV-2 остаться в циркуляции в его первоначальном виде. Более того, SARS-CoV-2 имеет очень ограниченный уровень смертности в случаях в отличие от SARS-CoV и MERS-CoV, не убивая хозяина, сможет производить новые вирусные частицы наряду с некоторыми мутациями. До сих пор большинство смертей происходило среди пожилого населения из-за новой коронавирусной инфекции, в то время как дети и молодые люди страдают относительно более легкой болезнью. Таким образом, SARS-CoV-2 инфекция позволит хозяину развить гуморальный и клеточно-опосредованный иммунитет, и одновременно выбранные иммунные вирусы могут приобретать мутации с более высоким инфекционным потенциалом или измененной антигенностью. Это, вероятно, позволит им уклониться от ранее существовавшего иммунитета (по отношению к своему предшественнику) в хозяине во время последующих волн инфекции. Текущие оценки, основанные на имеющейся информации, позволяют предположить, что более чем ∼93% человек восстановился после этой новой коронавирусной инфекции. В будущем вирус может адаптироваться, чтобы произвести инфекцию среди выздоровевшего населения и сохранить свое присутствие в окружающей среде. Мы должны подготовиться к мутантским штаммам этого нового вируса, чтобы избежать разрушения в будущем.
Поскольку против атипичной пневмонии и вакцины для борьбы с атипичной пневмонией (SARS CoV-2) не существует, вакцина или терапия в настоящее время являются первоочередной необходимостью. В настоящее время несколько компаний приступили к подготовке вакцин для этого нового вируса, хотя их эффективность будет зависеть от выбора антигена и способности вируса обойти иммунитет, вызываемый вакциной. При выборе правильных кандидатур на вакцину необходимо обратить внимание на сохранение среди различных эпитопов в выбранных иммунных штаммах. Структурно шипованный белок несет RBD, как и гемагглютинин (HA) вируса гриппа, с аналогичной функцией. Мы должны смотреть на сохранение аминокислот в различных областях белка шипа. Мутация в области иммунного доминирования кандидата на вакцину сделает их неэффективными для будущих вспышек. В последнее время врачи из Китая призывают выздоровевших пациентов жертвовать плазму, которая может быть полезна для защиты КОВИД-19, что-то вроде 100-летней практики во время гриппа 1918 года. В случае пандемии гриппа 1918 года три волны инфекции унесли более 50 миллионов жизней по всему миру за два года, где вторая волна была самой разрушительной. Первая волна пандемического гриппа 1918 г. была похожа на обычную эпидемию гриппа; люди, подвергавшиеся наибольшему риску, были слабыми и пожилыми, в то время как более молодые и здоровые люди легко выздоравливали, по-видимому, похожи на КОВИД-19 в его нынешнем виде. В большинстве исследований была обнаружена аналогия между КОВИД-19 и патофизиологией гриппозной болезни. Время покажет нам, будет ли атипичная пневмония SARS-CoV-2 и связанная с ней КОВИД-19 установлена в качестве нового гриппа 21 века.