Русская Духовная Миссия в Иерусалиме была основана в 1847 году. Состояла она тогда из возглавлявшего ее архимандрита Порфирия (Успенского), иеромонаха Феофана (будущего святителя, затворника Вышенского) и еще двух человек. Первоначально Русская Духовная Миссия не имела собственного помещения. Но в 1858 году после паломничества во Святую Землю Великого князя Константина Николаевича с супругой был решен вопрос о приобретении для Русской Духовной Миссии земельного участка в Иерусалиме. Этот участок находится на улице Яффа, вне стен старого города. В 1872 году здесь был построен большой Троицкий собор, в котором по сей день совершаются регулярные богослужения. Вокруг собора располагались административные здания Миссии с домовым храмом в честь мученицы царицы Александры и гостиница для паломников.
В задачи Миссии входила забота о многочисленных русских паломниках: их духовная поддержка, а также обеспечение жильем, питанием, медицинским обслуживанием. К сожалению, в 1964 году Никита Хрущев продал государству Израиль почти весь участок, принадлежавший Русской Миссии. В собственности Миссии остался только собор и часть одного из зданий.
В Троицком соборе находится чудотворный образ святителя Николая Чудотворца, спасший некогда русских паломников от гибели при кораблекрушении. Помещена эта икона на правом клиросе, во втором ряду.
