От распада Тибетской Империи в 842 г до монгольского вторжения в 1239 г. систематическое изложение истории края отсутствует, поскольку Тибет переживал период раздробленности. В некоторые исторические периоды город Шигадзе становился значимее Лхасы, между ними возникали политические противостояния. Во времена, когда Шигадзе был столицей Тибета, в городской крепости (дзонге)
находилась королевская резиденция. В ходе антикитайского восстания 1959 г. крепость была разрушена. От разгрома войсками Годан-хана (внука Чингисхана и сына Удэгея) страну спас Сакья-пандита Гунга-Джалцан (Sa skya Paṇḍita kun dga' rgyal mtshan), который проповедовал гуманистические основы буддизма в среде монгольской знати. Будучи человеком, уважаемым с обеих сторон, он до самой своей смерти обеспечивал своим авторитетом невмешательство Монгольской империи в дела Тибета. При этом он также контролировал выплату дани тибетцами монголам. Гунга-Джалцан получил почетное звание ученого брахмана Сакья-пандита благодаря