С 1944 года начинается активная передача Церкви отобранных у нее «культовых сооружений», это произошло из-за перемены ума руководства СССР, от постигших страну скорбей (подробнее в статье "Как Великая Отечественная изменила отношение СССР к Церкви") . Стоит заметить, что по возрастному составу две трети монашествующих тогда были старше 60 лет.
После окончания войны появилась острая необходимость в решении юридического статуса монастырей. По распоряжению центра было проведено обследование хозяйственного и правового положения монастырей, в результате чего постановлением Совмина СССР «О православных монастырях» от 29 мая 1946 года, для монастырей были установлены жесткие нормы поставок продовольствия государству, и определен их правовой статус.
С приходом к власти Н. С. Хрущева политика по отношению к Церкви кардинально изменилась: снова начались жестокие гонения на Церковь. В первую очередь пострадали монастыри и монашествующие, их число резко сократилось.
После отставки Н.С. Хрущева в 1964 году к управлению страной пришло более трезвомыслящее руководство, которое прекратило массовое закрытие религиозных общин. Но противостояние в отношениях между Церковью и государством продолжалось до 1988 года, когда, накануне 1000-летия крещения Руси состоялась встреча М.С. Горбачева с Патриархом Московским и всея Руси Пименом и постоянными членами Синода Русской Православной Церкви. Началось открытие монастырей, а после закона Верховного Совета СССР «О свободе совести и религиозных организациях» (1 октября 1990 г.) процесс восстановления монастырей достиг огромного размаха: к 1991 году на территории СССР было вместо 16 монастырей времен хрущевской «оттепели» - 117.