По мнению канадского исследователя Сюйхуа Ся, кишечник бродячих собак — идеальная среда для эволюции SARS-CoV-2. Именно здесь инфекция могла приобрести свойства, позволившие ей заражать людей.
Однако существуют и альтернативные точки зрения, отмечает Eurek Alert. Как полагает сотрудник Оттавского университета Сюйхуа Ся, источником SARS-CoV-2 могли быть не дикие животные, а бродячие собаки.
Ся много лет изучает взаимодействие вирусов и иммунной системы у разных хозяев. Особенно его интересует белок ZAP, который блокирует размножение вирусов. У человека эта молекула производится в костном мозге и лимфатических узлах, а работает в первую очередь в легких. Мишенью для ZAP служит так называемый CpG-динуклеотид — участок вирусной РНК, в котором цитозин соседствует с гуанином.
Однако вирусы способны противодействовать опасному для них белку. У некоторых из них, например, у ВИЧ и возбудителя атипичной пневмонии SARS-CoV, количество CpG-динуклеотидов в процессе эволюции уменьшилось, что снижает шансы ZAP обнаружить инфекцию. У таких вирусов сохранились лишь важнейшие для выживания CpG-динуклеотиды.
По словам Ся, чем меньше у вируса CpG-динуклеотидов, тем более он опасен. Изучив 1252 образцов генома SARS-CoV-2 и вируса летучих мышей BatCoV RaTG13, он обнаружил, что у них количество этих участков РНК наименьшее среди других коронавирусов. Единственным коронавирусом, в геноме которого было сходное количество CpG-динуклеотидов, оказался CCoV, вызывающий заболевание кишечника у собак. Судя по всему, в пищеварительном тракте этих млекопитающих вирусам приходится особенно быстро сокращать количество CpG-динуклеотидов.
На основе своих наблюдений Ся предложил следующий сценарий эволюции SARS-CoV-2. Предок коронавируса возник в организме летучих мышей, а затем стал поражать кишечник собак. Здесь он претерпел сильное давление отбора, который привел к снижению количества CpG-динуклеотидов. Это позволило вирусу стать менее уязвимым к человеческим ZAP-белкам и начать заражать людей.
Иными словам, кишечник бродячих собак мог послужить «лабораторией», в которой ускоренно эволюционировал предок SARS-CoV-2.
Чтобы стать полноценной научной гипотезой, идее Ся предстоит пройти проверку фактами. Пока, несмотря на 4-х месячные поиски, китайским специалистам не удалось установить ни точное место перехода вируса на человека (предполагается, что это произошло в Ухане, но не все специалисты верят в эту версию), ни животное, с которого был совершен этот переход. Достоверное нахождение природного источника инфекции позволит предотвратить возникновение подобных вспышек в будущем.