В феврале 1945 года советские войска вступили в Данциг (ныне польский Гданьск). Именно здесь находился анатомический институт, где проводились опыты по изготовлению мыла из человеческих жиров.
Германские власти к тому моменту даже не пытались уничтожить следы экспериментов над человеческими останками. Институт продолжал работать до самого последнего момента.
Специальная комиссия, созданная советскими властями, обнаружила целое производство, занимавшееся изготовлением мыла и кожаных изделий из человеческих останков.
Анатомический институт работал в тесном сотрудничестве с отделениями гестапо в Данциге и Кёнигсберге, которые поставляли медикам трупы заключенных для работы. Преимущественно это были тела поляков, евреев и советских граждан. Во время первоначального осмотра были обнаружены 148 человеческих тел, среди которых были и детские трупы. Все тела были приготовлены для того, чтобы быть переработанными.
Всего Шпаннер и его помощники изготовили около 100 кг мыла из людей. Показания, которые фигурировали на Нюрнбергском процессе, дали свидетели, работавшие в институте.
28 мая 1945 года Зигмунд Мазур показал на допросе, что он работал в анатомическом институте препаратором. Трупы поставлялись из тюрем Кёнигсберга и Данцига. По рецепту 5 кг человеческого жира с 10 литрами воды и 500-1000 г каустической соды варили 2-3 часа. После остывания мыло всплывало на поверхность. К смеси добавляли соль, соду, свежую воду и снова варили. Мыло имело неприятный запах, для уничтожения которого применялся бензальдегид. Мазур сообщил, что для своих нужд (для туалета и стирки) он использовал это мыло, взяв себе 4 кг.
Во время Нюрнбергского процесса советская сторона обвинения пыталась использовать деятельность Анатомического института в Данциге как одно из доказательств преступлений нацизма против человечества, однако не получила в этом поддержки других сторон обвинения. Объясняется это тем, что еще во время Первой мировой войны британцы распространяли информацию о том, что немцы варят мыло из военнопленных.
