События игры происходят между Half-Life и Half-Life 2: Аликс Вэнс и её отец Илай возглавляют раннее сопротивление против Альянса и жестокой оккупации Земли.
Воспоминания о поражении в Семичасовой войне ещё свежи. В тени Цитадели — крепости Альянса — жители Сити-17 учатся жить под властью захватчиков. Среди немногих оставшихся в живых жителей два самых изобретательных учёных Земли: доктор Илай Вэнс и его дочь Аликс — основатели зарождающегося сопротивления.Вы — Аликс Вэнс, и вам предстоит поднять восстание
Вы и ваш отец были переселены в Сити-17. Спустя годы вы продолжаете подпольную научную деятельность — проводите важнейшие исследования и создаёте важные инструменты для тех немногих, кто осмелился бросить вызов Альянсу.
- Каждый день вы узнаёте о враге что-то новое и каждый день ищете его уязвимости.