Масьяф был основан византийцами в долине Оронта, на пересечении
торговых путей Хама—Банияс и Антиохия—Хомс.
В 1103 году Масьяф захватывается Раймундом IV, графом Тулузы и Триполи[4].
Около 1140 года ассасины-низариты приобретают Масьяф и ещё несколько соседних крепостей у крестоносцев[4]. Масьяф становится главной крепостью ассасинов в Сирии.
В 1157 году в регионе происходит сильное землетрясение, разрушившее соседнюю крепость Шайзар[5].
В 1163 году главой («старцем горы») ассасинов Масьяфа становится Рашид ад-Дин Синан[6].
В 1176 году Масьяф безуспешно осаждался Саладином.
В сентябре 1193 года умирает Рашид ад-Дин Синан, «старец горы» Масьяфа и один самых значимых лидеров ассасинов-низаритов[7].
В 1256 году столица ассасинов, Аламут взята монголами, а в 1260 та же участь постигла и Масьяф[8]. В том же году мамлюки (при участии ассасинов на его стороне) под предводительством султана Бейбарса I разгромили монголов в битве при Айн-Джалуте и изгнали их из Сирии. Ассасинам удалось вернуть Масьяф, а также ещё несколько крепостей.
В 1270 году Бейбарс включает Масьяф в состав государства Мамлюков. Последняя крепость низаритов, Аль-Каф, становится частью Мамлюкского султаната в 1273 году[6].
В 1516 году Масьяф захвачен турками-османами. Вплоть до XIX века продолжалась борьба между низаритами и алавитами за контроль над городом[4].
В 1920 году входит в состав государства Алавитов под французским мандатом.
5 декабря 1936 года, вместе со всем государством Алавитов, Масьяф входит в состав Сирии.
С 2000 года программа поддержки исторических городов Ага-Хана (HCSP) проводит кампанию по сохранению города и крепости Масьяф[9].