Мэтью сбегает с комплекса и прячется на яхте, пришвартованной около берега. В итоге он остается один на острове с кучей мутантов и трупом своей маленькой дочери, попутно окончательно теряя рассудок.
И очередной раз, собирая остатки полезных вещей из комплекса, Мэтью замечает на радаре пролетающий самолет и понимает, что это его шанс. Он самостоятельно активирует артефакт и выброс энергии задевает самолет, в следствии чего он падает на остров...
И вот начинается сама игра. Мы просыпаемся от того, что на самолете отключается вся электроника, и самолет падает. После падения мы на несколько секунд приходим в себя и видим, что какой-то красный человек забирает нашего сына и уходит, после чего мы опять теряем сознание.
Спустя время мы приходим в себя, нашей главной целью становиться выжить на острове среди мутантов и найти своего сына. Мы начинаем обустраивать свою базу, попутно убиваю аборигенов, после блуждений по острову мы находим пещеры наполненные мутантами, которые после взрыва на sahara нашли себе убежище в пещерах. Так же в пещерах и на самом острове мы находим много информации о комплексе Sahara и о том, что там происходило.
По ходу игры мы находим нужные для прохождения в комплекс вещи, такие как акваланг и ключ-карта, открывающая главный вход. Мы попадаем в комплекс и узнаем все секреты Sahara. Мы проходим горы трупов сотрудников комплекса и находим того самого красного человека, которым оказывается Мэтью Кросс, укравший сына. После мы находим артефакт, при открытии которого из него выпадает уже мертвое тело сына главного героя.
Мэтью верил, что сможет оживить свою дочь с помощью артефакта, и для этого ему нужна была жизнь другого ребенка. Тем ребенком оказался сын главного персонажа. И у Мэтью вышло оживить дочь, но только она была уже не его дочерью. Как и в прошлые разы артефакт делал из детей мутантов, и этот случай не был исключением. Меган превратилась в мутанта, которого главный герой должен одолеть.
После победы над Меган главный герой находит ключ-карту от офиса Мэтью и попадает внутрь, где находиться артефакт, с помощью которого Мэтью сбил самолет. Главный герой видит на радаре пролетающий самолет и от безнадежности нажимает кнопку активировать...
И вот история снова повторяется: падение самолета, похищение ребенка,попытка все изменить и... и провал,замкнутый круг. Именно так кончается игра The forest.