Предлагаю вашему вниманию перевод статьи доктора наук по молекулярной биологии, напечатанной недавно в журнале "Новости науки". Оригинал статьи на английском можно прочитать здесь.
Заголовок: “Нет, коронавирус не был сделан в лаборатории. Генетический анализ показывает, что он чисто природного происхождения. Ученые всерьёз восприняли конспирологию об искусственном происхождении SARS-CoV-2 и развенчали её”
Согласно новому исследованию, пандемия коронавируса, распространяющаяся по всему земному шару, вызвана природным вирусом, а вовсе не вирусом, созданным в лаборатории. Генетическая структура вируса показывает, что SARS-CoV-2 не является мешаниной из известных вирусов, как можно было бы ожидать, будь она создана человеком. И то, что у него есть необычные особенности, которые только недавно были обнаружены в чешуйчатых муравьедах, называемых ящерами, является свидетельством того, что вирус пришел к нам из природы, сообщают Кристиан Андерсен и его коллеги 17 марта в Nature Medicine.
Когда Андерсен, исследователь инфекционных заболеваний в Научно-исследовательском институте Скриппса в Ла-Хойя, Калифорния, впервые услышал о коронавирусе, вызвавшем вспышку в Китае, он удивился, откуда взялся этот вирус. Первоначально исследователи полагали, что вирус распространяется посредством повторяющихся инфекций, которые прыгают с животных на рынке морепродуктов в Ухане, Китай, на людей, а затем передаются от человека к человеку. Анализ, проведенный другими исследователями, позволил предположить, что вирус, вероятно, прыгнул от животного к человеку только один раз и потом уже распространялся от человека к человеку примерно с середины ноября (SN: 3/4/20).
Но вскоре после того, как в начале января была выявлена генетическая структура вируса, начали распространяться слухи о том, что, возможно, вирус был разработан в лаборатории и - преднамеренно или случайно – выпущен наружу. По словам Роберта Гарри, вирусолога из Университета Тулейна в Новом Орлеане, одно не совсем удачное совпадение подпитывает теоретиков заговора. Уханьский институт вирусологии находится “в непосредственной близости” от рынка морепродуктов и проводит исследования вирусов, в том числе коронавирусов, обнаруженных у летучих мышей, которые могут вызывать заболевания у людей. «Это привело людей к мысли, что, о, они (вирусы) утекли и попали в канализацию, или кто-то из сотрудников выскочил из лаборатории и пошел на рынок или что-то в этом роде», - говорит Гарри. Случайные выбросы вирусов, в том числе атипичной и пневмонии, происходили из других лабораторий в прошлом. Так что «такой вариант нельзя сразу отбросить как нечто невероятное», - говорит Андерсен. «Это было бы глупо».
В поисках улик
Андерсен собрал группу эволюционных биологов и вирусологов, включая Гарри, из нескольких стран, чтобы проанализировать вирус на предмет того, что он мог быть создан человеком, или выращен и случайно выпущен из лаборатории. «Мы сказали: «Давайте рассмотрим эту теорию, о которой существует множество разных версий - что вирус имеет неестественное происхождение - … как серьезную потенциальную гипотезу», - говорит Андерсен. Работая совместно через Slack и другие виртуальные порталы, исследователи проанализировали генетическую структуру вируса, или последовательность РНК, чтобы выяснить его происхождение.
По словам Андерсена, «почти в одночасье» стало ясно, что вирус не был создан человеком. Любой, кто надеется создать вирус, должен будет работать с уже известными вирусами и создавать им нужные свойства. Однако вирус SARS-CoV-2 имеет компоненты, которые отличаются от компонентов ранее известных вирусов, поэтому они обязаны происходить только от какого-то природного ещё неизвестного вируса или вирусов. «Генетические данные неопровержимо показывают, что SARS-CoV-2 не получен из какой-либо вирусной несущей конструкции, использованной ранее», - пишут Андерсен и его коллеги в исследовании. «Это не тот вирус, что кто-то смог бы придумать или смоделировать. У него слишком много отличительных черт, некоторые из которых нелогичны», - говорит Гарри. «Вы бы так не делали, если бы пытались создать смертоносный вирус».
Другие ученые согласны. «Мы не видим абсолютно никаких доказательств того, что вирус был спроектирован или преднамеренно выпущен», - говорит Эмма Ходкрофт, молекулярный эпидемиолог из Университета Базеля в Швейцарии. Эмма не была частью группы Андерсена, но является членом команды ученых с Nextstrain.org, которая отслеживает небольшие генетические изменения в коронавирусе, чтобы узнать больше о том, как он распространяется по всему миру. Этот вывод опровергает очень сомнительный анализ, опубликованный на bioRxiv.org до начала экспертной проверки, в котором утверждается, что в коронавирусе обнаружены частички ВИЧ, говорит Ходкрофт. Другие ученые быстро указали на недостатки в том исследовании, и его авторы отказались от отчета, но не раньше, чем этот отчет уже помог распространить миф о том, что вирус был создан искусственно.
По словам Ходкрофта, некоторые участки генетического материала вируса действительно похожи на ВИЧ, но это происходит от вирусов, имеющих общего предка в ходе эволюции. «По сути, это примерно также как если бы я взял книгу Одиссея и сказал: «О, в ней есть слово "бы", а затем открыл другую книгу, увидел там слово "бы" и сказал: «О, черт возьми, это же тоже самое слово, значит в этой другой книге есть отрывки из Одиссеи», - говорит она. «Это было действительно ложное утверждение и действительно плохая наука».
Нахождение своеобразных особенностей
Затем группа Андерсена решила выяснить, не был ли вирус случайно выпущен из лаборатории. Это реальная возможность, потому что исследователи во многих местах работают с коронавирусами, которые могут заразить людей, говорит он. «Материал иногда выходит за пределы лаборатории, почти всегда случайно», - говорит он.
По словам Андерсена, на глаза исследователям попалась пара неожиданных особенностей вируса. В частности, ген, кодирующий остроконечный белок коронавируса, содержит 12 дополнительных РНК-структурных блоков или нуклеотидов, застрявших в нем. Этот остроконечный белок выступает из поверхности вируса и позволяет вирусу прикрепиться и проникнуть в клетки человека. Эта вставка строительных блоков РНК добавляет четыре аминокислоты к шиповидному белку и создает место в белке для фермента, называемого фурином. Фурин вырабатывается в клетках человека и расщепляет белки только в тех местах, где обнаружена определенная комбинация аминокислот, например, созданная путем вставки. SARS и другие вирусы, подобные SARS, не имеют таких мест.
Открытие мест расщепления фурином стало неожиданностью, говорит Гарри. Когда вирусы птичьего гриппа приобретают способность уничтожать фурин, вирусы часто становятся более легко передаваемыми. Внедрение также создало места, где молекулы сахара могли быть прикреплены к шиповидному белку, создавая щит для защиты вируса от иммунной системы. Шиповидный белок вируса COVID-19 также более тесно связывается с белком в клетках человека, называемым ACE2, чем SARS (SN: 3/10/20). Более плотное связывание может позволить SARS-CoV-2 более легко инфицировать клетки. Вместе эти особенности могут объяснить, почему COVID-19 настолько заразен (SN: 3/13/20).
«Это очень своеобразно, эти две особенности, - говорит Андерсен. «Как мы можем объяснить, как это произошло? Я должен быть честным. Я был скептичен [что это было естественно]. Это могло произойти в культуре клеток тканей» в лаборатории, где вирусы могут приобретать мутации, поскольку они многократно размножаются в лабораторных чашках. В природе вирусы, несущие некоторые из этих мутаций, могут быть отсеяны естественным отбором, но могут сохраняться в лабораторных чашках, где даже слабым вирусам не приходится бороться за выживание.
Заключая аргументацию в пользу природного происхождения
Но затем исследователи сравнили SARS-CoV-2 с другими коронавирусами, недавно обнаруженными в природе, в том числе у летучих мышей и ящеров. «Похоже, что SARS-CoV-2 может быть смесью вирусов летучей мыши и ящера», - говорит Гарри. Вирусы, особенно РНК-вирусы, такие как коронавирусы, часто меняют гены в природе. Поиск генов, связанных с вирусами у ящеров, был особенно обнадеживающим, потому что генетическая структура этих вирусов была известна только после открытия SARS-CoV-2, что делает маловероятным, чтобы кто-то работал с ними в лаборатории, говорит он.
В частности, ученые обнаружили, что у ящеров также имеются аминокислоты, которые вызывают сильное привязывание шиповидного белка к ACE2. «Ясно, что это то, что легко может случиться в природе», - говорит Андерсен. «Я думал, что это была очень важная маленькая подсказка. Это показывает, что нет ничего загадочного в его более тесной связи с человеческим белком, потому что аналогично происходит и у ящеров».
По словам Андерсена, места прикрепления сахароз были еще одним признаком того, что вирус является естественным. Сахар создает «слизистый щит», который защищает вирус от атаки иммунной системы. Но лабораторной посуды для культуры тканей по определению нет иммунной системы, поэтому маловероятно, что такая адаптация возникнет в результате выращивания вируса в лаборатории. «Это объясняет гипотезу культуры ткани», - говорит он.
По словам Ходкрофта, сходство SARS-CoV-2 с вирусами летучей мыши и ящера является одним из лучших доказательств того, что вирус является естественным. «Это было просто очередное распространение животных на людей», - говорит она. «Это действительно самое простое объяснение того, что мы видим». Исследователи до сих пор не уверены, какое именно животное было источником.
Андерсен говорит, что их анализ вряд ли положит конец конспирологии. Тем не менее, он считает, что анализ стоил того. «Я сам сначала относился скептически и не знал, что и подумать», - говорит Андерсен, но теперь он убежден. «Все данные показывают, что этот вирус естественного, а не искусственного происхождения».