В настоящее время в мире ведется работа над вакциной против коронавируса SARS-CoV-2. Саммит - самый быстрый суперкомпьютер в мире - также может помочь в его создании.
Исследователи из Американской национальной лаборатории Ок-Риджа (ORNL )
используют вычислительную мощь самого быстрого суперкомпьютера в мире для поиска вакцины против коронавируса . Саммит, потому что это имя компьютера, изготовленного IBM, всего за два дня выявил 77 химических соединений, которые потенциально могут предотвратить прикрепление «шипов» коронавируса к клеткам человека.
Исследователи ORNL, которые тестировали до 8000 химических соединений в ходе своих испытаний на предмет их полезности при разработке вакцин, подчеркивают, что для проведения таких расчетов в обычной лаборатории потребуются годы. Значит ли это, что мы приближаемся к разработке вакцины против коронавируса?
Наши результаты не означают, что мы нашли лекарство от коронавируса. Однако я надеюсь, что наши результаты послужат основой для будущих исследований, а также создадут основу, которую экспериментаторы будут использовать для дальнейшего изучения этих соединений.
- заявил в своем заявлении Джереми Смит, директор Ок-Риджской национальной лаборатории (ORNL).
Команда Джереми Смита теперь должна будет перезапустить компьютерное моделирование, используя обновленную модель коронавируса, которая была опубликована в марте. Новый анализ может привести к перестановкам в «рейтинге» соединений, которые потенциально наиболее полезны при разработке эффективной вакцины против SARS-CoV-2.
Как суперкомпьютер может помочь в борьбе с коронавирусом?
Вирусы заражают клетки, связываясь с ними и используя их «шипы» для инъекции своего генетического материала в клетку-хозяина. Чтобы лучше понять биологические соединения, такие как вирусы, исследователи «выращивают» их в лабораториях и смотрят, как они реагируют на новые соединения. Это утомительный процесс, который можно ускорить.
И тут суперкомпьютер вступает в действие. Благодаря его мощным вычислительным возможностям он может в короткие сроки выполнять сложные моделирования и изучать реакцию отдельных соединений на вирус. Эти типы моделирования должны учитывать миллиарды уникальных точек данных.
Саммит определенно подготовлен к таким расчетам. Компьютер производства IBM - настоящий зверь. Устройство оснащено 9 216 процессорами IBM POWER9, 27 648 графическими процессорами Nvidia Tesla V100 и может выполнять 200 миллиардов вычислений в секунду. Миллиард - это одна тысяча триллионов, один миллион миллиардов или один миллиард миллионов. Вычислительная мощность Summit составляет 148,6 петафлопс, что делает его в настоящее время самым быстрым суперкомпьютером в мире.
