Найти тему

Коронавирус толкает складной краудсорсинга молекулярной науки@дома для того, чтобы носить уровней

Длительные складывая@Home программу отыщут чрезвычайно сложная задача, решить молекулярных взаимодействий достиг важной вехой как тысячи новых пользователей зарегистрируйтесь, чтобы положить свои компьютеры для работы. В настоящее время сеть включает в себя “носить” вычислительной мощности: операции 1,000,000,000,000,000,000 в секунду.

Складывая@дома началось около 20 лет назад как способ — то романа, и впервые сейчас-в спячке сети Эт Хоум — развалить вычислений тяжелых проблем и посылки их лицам для исполнения. Это равносильно сырой суперкомпьютер распределенных по всему земному шару, и, хотя это не так эффективно, как “настоящий” суперкомпьютер в взрывных через расчеты, он может сделать короткую работу сложных проблем.

Данная проблема решается с помощью этого инструмента (администрируется группой в Университете Вашингтона в Сент-Луисе) заключается в том, что сворачивания белков. Белки являются одним из многих химических структур, которые делают нашу работу по биологии, и они варьируются от небольших, достаточно сложной молекулы до поистине огромных.

Особенность белков в том, что они меняют свою форму в зависимости от условий — температуры, рН, наличие или отсутствие других молекул. Это изменение в форме, что часто делает их полезными — например, кинезин белок меняет форму, как пара ног принимают меры для передачи данных через сотовый. Другой белок, как ионный канал будет открыт, чтобы позволить заряженных атомов через, только если другой белок присутствует, который вписывается в нее, как ключ в замок.

Кредит изображения: части Кипра и соавт.

Некоторые такие изменения, или извилин, хорошо документированы, но большинство однозначно совершенно неизвестно. Но через надежный моделирования молекул и их окружения мы можем обнаружить новую информацию о белках, которые могут привести к важным открытиям. Например, что, если вы могли бы показать, что когда-то, что ионный канал открыт, другой белок может заблокировать его, что путь дольше, чем обычно, или закрыть его быстро? Поиск этих возможностей является то, что такого рода молекулярная наука.

К сожалению, это также чрезвычайно вычисления-дорого. Эти меж - и внутримолекулярных взаимодействий является то, что суперкомпьютеры могут перемалывать бесконечно, чтобы покрыть все возможности. Двадцать лет назад суперкомпьютеры были намного реже, чем сегодня, поэтому складывая@дома началась, как способ сделать этот вид тяжелой вычислительной нагрузки без покупки установки Крей 500 миллионов долларов.

Программа была пыхтит все время, и, вероятно, получил стимул к росту, когда сети@Home и рекомендовал его в качестве альтернативы для многих пользователей. Но коронавирус кризис внес идею вклада ресурсов в великое дело весьма привлекательной, и как таковой был огромный прирост пользователей — настолько, что серверы пытаются сделать проблемы на всех компьютерах, чтобы решить.

Примеры COVID-19-связанных белков визуализировали путем складывания@дома.

Вехи его празднует это достижение производителей вычислительной мощности, который я считаю секстиллион (миллиард миллиардов) операций в секунду. Операция-это логическая операция, как и или НИ, и некоторые из них образуют математические выражения, которые в конечном итоге складываются в полезные вещи, как говорят “при температуре выше 38 градусов по Цельсию белок деформируется, чтобы позволить лекарства чтобы привязать на этом сайте и отключить его.”

Эксафлопсных вычислений следующая цель суперкомпьютеров

Intel и Национальной лаборатории Аргонн на эксафлопсных и их новый суперкомпьютер Аврора

Естественно, эти две вещи нельзя сравнивать напрямую — с Folding@home-это маршалинг собой носить запас вычислительной мощности, но он не работает как единое целое, работающих по одной проблеме, как эксафлопсных системы строятся на. В еха - метка есть, чтобы дать ощущение масштаба.

Будет такой анализ приведет к лечению коронавирус? Возможно, позже, но почти наверняка не в ближайшем будущем. Протеомика-это “фундаментальные исследования” в том, что она в душе, лучшее понимание мира вокруг (и внутри) нас — срок.

COVID-19 (такие как болезнь Паркинсона, Болезнь Альцгеймера, ALS и др.) не одной проблемы, но большой, слабо ограниченного множества неизвестных

Как проект, отметил в блоге, объявив о выпуске коронавирус работы:

Это первая волна проектов направлена на лучшее понимание того, как эти коронавирусы взаимодействовать с человеческим ACE2 и рецепторов, необходимых для проникновение вируса в человеческие клетки-хозяина, и как исследователи могли бы помешать их путем разработки новых терапевтических антител или малых молекул, которые могут нарушить их взаимодействие.

Если вы хотите помочь, вы можете скачать складывая@дом клиента и подарить свой запасной циклов CPU и GPU делу.