Бронетранспортер БТР-80А является модификацией БТР-80 с сохранением основных узлов и агрегатов. Особенностью БТР-80А является принципиально новый комплекс вооружения. Машина вооружена башенной пушечно-пулеметной установкой с наружным размещением 30-мм автоматической пушки 2А72 и спаренного с ней 7,62-мм пулемета. Установка автоматической пушки значительно (в 2 раза) повысила боевую эффективность БТР.
Питание пушки – двухленточное: одна лента с осколочно-фугасно-зажигательными (ОФЗ) или осколочно-трассирующими (ОТ), другая – с бронебойно-трассирующими (БТ) снарядами. Наружное расположение вооружения существенно снижает загазованность обитаемых отделений бронетранспортера. БТР-80А оснащен средствами связи, системой защиты от оружия массового поражения, противопожарным оборудованием, водооткачивающими средствами, системой обеспечения обитаемости.