Коробка передач (обычно двухскоростная) значительно улучшает ходовые качества мопеда. Довольно часто переключение передач осуществляется поворотом левой ручки на руле (её нужно повернуть после нажатия на рычаг сцепления). Педальный узел совмещен с коробкой передач. Как и с классическим мопедом, у мопед с коробкой передач можно запустить двигатель, вращая педали или таким же образом помочь двигателю в тяжёлых условиях.Примеры таких мопедов: «Верховина»,«Рига-1, 3, 4».
