9. В одном из уровней на стене висит большая фотография Гордона Фримена с подписью: "Лучший работник месяца".
10. В главе "Подменённая реальность" в помещении с барнаклом присутствует разбитая витрина, над которой сверху написано "007". Это отсылка к агенту 007 и его способности выбираться из любых передряг.
11. В главе "Дружественный огонь" на одной из досок, помимо документов, можно найти фотографию Роба Хейронимуса, главного дизайнера игры.
12. В главе "Логово пещерного червя" игроку требуется включить Valve (вентиль) и Gearbox (коробку передач), а также Steam (пар). Первые две - это компании-создатели игры, а Steam - это система цифровой дистрибуции Valve. Интересно то, что Steam тогда ещё не существовало даже в разработке Valve, и эта надпись является простым совпадением.
13. Помещение с уплотнителем мусора в той же главе скопировано с одной из локаций фильма "Звёздные войны IV: Новая надежда".
14. Если ввести в консоли команду "haiku", то на экране появится случайное хокку.
15. В битве с финальным боссом, если прокрутить одну из его фраз в обратную сторону, то можно услышать "To win the game, you must kill me, Randy Pitchford" (Чтобы победить в игре, ты должен убить меня, Рэнди Питчфорда.). Данная фраза по мимо всего прочего еще и является отсылкой на аналогичную отсылку из "Doom II: Hell on Earth", в которой в финальном сражении проигрывалась в обратную фраза "To win the game, you must kill me, John Romero" (Чтобы победить в игре, ты должен убить меня, Джона Ромеро).
16. Многие объекты на картах, как видно через Valve Hammer Editor, названы в честь сотрудников Gearbox. Также их названия содержат нецензурные насмешки над игроком и отсылки к всё тем же "Звёздным войнам" (например, скрипт прыжка Гордона Фримена в портал назван run_luke_run - "Беги, Люк [Скайуокер], беги!"). Традиция шуточных названий была продолжена в Blue Shift.
17. Если в телепортационной комнате зайти в портал вслед за Фрименом, то можно попасть на первую локацию Зена из оригинальной Half-Life, однако игрок провалится в бездну, и игра завершится, обвинив игрока во "временном парадоксе". При этом, Фримен будет стоять на том же самом островке, на который он попадает после телепортации.