На самом деле больше 99,9999% атома- это пустое пространство. Атом состоит из крошечного плотного ядра окружённого облаком электронов, которые в пропорциональном отношении занимают больше пространства. Всё потому, что электрон движутся полнообразно. Они могут существовать болько там, где гребни и впадины волн складываются определённым образом. Электрон не остаются в одной точке, их местоположение может быть где угодно в пределах орбиты. И потому они занимают очень много места.