1. Клеймор
Развитие сюжета происходит в альтернативном Средневековье, где люди сражаются с ёма (яп. 妖魔 ё:ма), оборотнями, питающимися человеческим мясом. Съев мозги человека, чудовище способно завладеть его воспоминаниями. Кроме того ёма могут принимать облик своих жертв, таким образом скрываясь среди людей. Они намного сильнее и быстрее обычного человека, и противостоять им, даже используя оружие, практически невозможно — сверхъестественная сила ёма основана на использовании магической энергии, также именуемой «ёки».
С целью борьбы с ними тайная Организация создала группу могучих воинов, получивших прозвище «Клеймор» из-за своих огромных мечей. Все они — полулюди-полумонстры, выращенные из детей, в чьё тело были внедрены плоть и кровь ёма. Их сила и ум зачастую превосходят генный оригинал. Эти полукровки способны чувствовать потоки ёки и, таким образом, находить самих монстров. Все Клеймор за исключением 1го поколения — женщины. Они не стареют и могут умереть только насильственной смертью. Обычные люди побаиваются их, несмотря на то, что Клеймор запрещено убивать людей, и нарушение этого правила сурово наказывается.
Организация существует за счёт выполнения заказов различных городов на уничтожение ёма. Однако если тот или иной город отказывается оплатить работу, то Организация более с ним не сотрудничает, и ёма, обычно быстро узнающие об этом, уничтожают его.
Клеймор, также как и ёма, для сверхъестественных действий использует ёки. При частом использовании ёки человеческая природа Клеймор сходит на нет, и они становятся полноценным чудовищем, более сильным, умным и опасным, чем обычные ёма; это называется «пробуждение (яп. 覚醒 Какусэй)». Большинство Клеймор считают пробуждение хуже смерти и, чувствуя приближение этого момента, посылают одной из своих соратниц Чёрную карту — просьбу об умерщвлении, таким образом выбирая лучший для человечества вариант.
В главах манги, которые не охватил аниме-сериал 2007 года, выясняется, что мир намного больше, чем это казалось. Две державы — страны потомков драконов и страна, к которой принадлежит Организация, — ведут борьбу между собой. Остров, где происходили описанные до этого события, является лишь территорией для экспериментов Организации, создавших ёма, Клеймор, Порождение Бездны и других существ с целью вывести идеального воина.
2. Берсерк
Вымышленный мир манги «Берсерк» напоминает Европу приблизительно XIV—XV веков (в новой экранизации много доспехов начала XVI века). Основное место действия — королевство Мидланд, которое граничит с империей Тюдор. Между ними идёт война, которая не прекращается вот уже сто лет. На Востоке располагается обширная Кушанская империя, её культура напоминает индуистскую. Кроме того, существует ещё несколько меньших по размеру королевств, графств, республик и городов-государств.
Хотя действие «Берсерка» и происходит в фэнтези-сеттинге, магия в его мире распространена незначительно. Широкое распространение она имеет лишь на Востоке, где маги подчиняются императору Ганишке. На Западе магией владеют лишь немногочисленные ведьмы, за которыми охотится Святая Инквизиция, поскольку магия активно порицается религией Святого Престола. Церковная организация схожа с инквизицией из католицизма, глава также носит титул папы, а город происхождения носит название Ватикан.
3. Скитальцы
Симадзу Тоёхисе во время битвы при Сэкигахаре удаётся смертельно ранить Ии Наомасу, при этом он сам был тяжело ранен. Тоёхиса покидает поля боя раненым и с обильным кровотечением, после этого попадает в длинный коридор с множеством дверей, посреди которого стоит стол и за ним сидит странный человек в очках, который его ждет. Этот человек — Мурасаки, записывая что-то в своём бланке, отправляет Тоёхису против его воли в ближайшую дверь, после выхода из которой, он просыпается уже в другом мире. Там Тоёхиса встречает других великих воинов, подобных ему, которые являются частью группы, именуемой «Скитальцы».
В новом для себя мире Тоёхиса встречает как обычных людей, так и ряд фантастических существ, включая эльфов, гномов и хоббитов. Этот мир находится в состоянии войны, люди ведут безуспешную войну против другой группы великих воинов — «Эндов», которые хотят захватить власть над миром и убить всех людей вкупе со Скитальцами. Под командованием Эндов много ужасных существ, в том числе драконы, которых они используют, чтобы уничтожить всё на своем пути. В начале истории армия Эндов контролирует северную часть континента, и в настоящее время пытается вторгнуться на юг через крепость на севере страны под названием Карнеад. Между тем, организация «Октябристы» — группа людей-магов, для которых этот мир родной, пытаются найти и свести вместе как можно больше всевозможных Скитальцев, чтобы спасти свой мир от жестоких Эндов.