Музей кафедры анатомии Казанского медицинского университета расположен в здании Анатомического театра, которое является уникальным памятником русского классицизма XIX века. Музей на кафедре был открыт в 1837 году.
Построено специально по образу Анатомических театров эпохи Возрождения для проведения анатомических вскрытий, изучения анатомии и распространения анатомических знаний. Здание Анатомического театра по плану представляет четырехугольник, средняя часть которого выступает полуротондой с восемью ионическими колоннами.
Центр здания занимает зал — двухсветная ротонда. Внутренний полукруг 2-го этажа этой аудитории имеет красивую колоннаду со стильной решеткой, замыкающей хоры, покрытые высоким куполом. На фризе здания латинская надпись «Hiс lokus est, ubi mors gaudet succurrere vitae» — «Здесь место, где смерть рада помочь жизни»
С этого момента на кафедре начали появляться различные коллекции: тератологическая — уродцы препараты голландского анатома Рюиша, препараты французской фирмы Tramond, Paris (XIX в.), мумии (XIX в.), уникальная краниологическая коллекция (XIX в.), коллекция скелетов (XIX в.).