Армии Шао Кана планомерно захватывали территории Земного Царства. Вторжение шло своим чередом, а потому у Императора появилась возможность отдохнуть.
Но отдыхать он не собирался. Вместо этого правитель Внешнего Мира обратил свой взор на Преисподнюю, где обитало большое количество бесхозных душ. И их-то он и захотел получить, привлекая к себе внимание падшего бога Шиннока, томившегося под тощей земли.
Пока Шао Кан давал распоряжения о слежке за Императором своему верному слуге Нуб Сайботу, из Преисподней были похищены первые души. Среди них оказался дух Скорпиона, который сначала даже согласился служить Внешнему Миру, желая окончательно разорвать все свои связи с Шинноком и Куан Чи.
Но потом тот, кого звали Ханзо Хасаши узнал, что на стороне Земли сражается младший брат его давнего противника, Саб-Зиро. И ему Скорпион поклялся не причинять вреда, а потому адский ниндзя сменил сторону и присоединился к войскам Земного Царстве в их борьбе с захватчиками.
Вместе с предательством Скорпиона, Шао Кан узнал еще одну не слишком приятную для него новость. На поле боя неожиданно появились странные противники, которые могли перевесить чашу весов.
Киборги - создания без души, которые могли дать отпор армиям Внешнего Мира. Однако Шао Кан даже не подозревал, что роботов интересуют не его люди, а поимка Саб-Зиро. Просто по пути им преградили дорогу мерзкие твари Внешнего Мира, а потому киборги стали их уничтожать, как досадную помеху.
В процессе поисков бывшим ниндзя все таки удалось обнаружить беглеца. Первым его настиг Смоук, который под напором Саб-Зиро смог вспомнить свою былую жизнь. Это повлияло на желание Смоука перейти на сторону своего истинного товарища. А когда к защитникам Земли присоединился и Рейден в образе человека, было решено готовиться к атаке на Императора Шао Кана.
