«Что» не всегда является союзом, поэтому правила пунктуации не требуют постановки запятых.
Например, он почти что съел суп. Здесь «почти что» - наречие, единое целое, которое нельзя разделить запятой. Можно убрать «что», и смысл предложения не изменится.
Также неразложимые словосочетания с подчинительными союзами и союзными словами не обособляются внутри себя. К ним можно отнести: во что бы то ни стало, кто во что горазд, самый что ни на есть, будь что будет и другие.
Например. Природа там что ни на есть хорошая. Надо сделать все во что бы то ни стало. И пусть будь что будет.
Неразложимые сочетания с отрицательными и ограничительными частицами также не обособляются внутри словосочетания. Не только что, не то что.
Твоей линейкой не только что квартиру, но и треугольник в тетради не измеришь. Он не то что не услышал меня, просто сделал вид.
В неразложимых сочетаниях с местоименными и наречными словами не ставится запятая внутри оборота. Сочетания: неизвестно что, непонятно что, всё равно что, редко что, неведомо что, мало что.
К примеру. Он мало что знает. Решает непонятно что.
Конструкции с составными подчинительными союзами (ввиду того что, несмотря на то что, потому что и другие) не разделяются, если не выполняются некоторые условия:
- Перед конструкцией есть отрицательная частица. Не потому, что я тебя давно знаю.
- Если перед союзом стоят вводные слова или выражения, наречия, усилительные и ограничительные частицы. Вероятно, потому, что он тебе наврал.
В остальных случаях составные союзы не расчленяются.