1. Старт Аниме Боруто вышло в свет почти спустя год после того, как появилась манга. Хоть пролог был и одни и тем же, как в аниме, так и в манге, но вот история берет свое начало совсем по-разному. В манге первая арка сделала пересказ событий аниме-фильма Боруто. А в случае с аниме начинается все с поступления Боруто в академию ниндзя. Оригинальное повествования аниме длилось почти год и только совсем недавно стало приближаться к событиям манги.
2. Дополнительные персонажи Исходя из того, что аниме берет свое начало с провождения времени в академии ниндзя, неудивительно, что нас познакомили с таким большим количеством персонажей. Большинство из учеников академии до сих пор не появились в манге, к примеру, такие как Иваби и Денки С одной стороны аниме позволяет нам познакомиться с новым поколением и миром Наруто, а с другой манга выглядит куда лаконичнее и не тратит много времени на знакомство с персонажами, стараясь как можно глубже уйти в сюжет.
3. Экзамен на чунина Экзаменам на Чу