Маракеби и др. считают, что революция в технологии секвенирования ДНК теперь позволяет нам смотреть геномы последовательностей любого размера и по низкой цене. В результате этой революции может быть также выявлен уровень генетического разнообразия, который не может быть классифицирован и назван надлежащим образом в рамках нынешней системы биологической классификации. Отметив три важных недостатка нынешней системы биологической классификации и номенклатуры, они предложили идею создания новой исключительно основанной на геноме системы классификации и наименований в дополнение к существующей системе биологической классификации и привели примеры применения кодов на основе генома в биологических науках и за их пределами.
Номенклатура
Открытие и наименование живых организмов (любых форм жизни, включая растения, животных и микробы) привлекло большое внимание на протяжении всей истории человечества. Термин "номенклатура" охватывает систему наименования организмов посредством построения, толкования и применения положений, регулирующих эту систему.
Ранг вида имеет особое значение в иерархии и является эталоном, по которому оцениваются другие виды. Эта важность находит свое отражение в жестко регламентированном процессе номенклатуры нового вида (номенклатуры) с новыми названиями в ранге вида, требующими описания фенотипических признаков на латыни, обозначения типа образца (контрольного лица, принадлежащего данному виду), а также создания нового биномиального и авторитетного.
Типовые образцы более высокого ранга относятся к обозначенным видам (типам). Единообразные и международно признанные принципы наименования растений были разработаны на ряде совещаний Международного (ботанического) конгресса и впервые опубликованы в официальной публикации под названием Международный кодекс ботанической номенклатуры (МКБН), правила которого были разработаны на Международном конгрессе в Кембридже (Англия) в 1930 году.
Однако эти правила, в свою очередь, были заимствованы из предыдущих правил, самые ранние из которых были приняты Парижским конгрессом в 1867 году. Названия необходимы для того, чтобы избежать описательных фраз, отсылающих к организмам и облегчающих общение. Например, в 1738 году Линней назвал вид "Plantago foliis ovatis Glabris". Однако с увеличением количества видов растений эта фраза стала недостаточной для однозначного распознавания таксона. Так в 1753 году Линней назвал его "Plantago foliis ovatis glabris, undo scapo tereti, spica flosculis imbricate". Такие названия оказались непрактичными, поэтому с 1753 года Линней использовал биномиальную (двоичную) систему номенклатуры, а для видов Плантаго он дал Плантаго майорскую (Stace, 1989).
Обычно растениям присваиваются названия либо на латыни, либо с другого языка, а затем "латинизированные". Для большей ясности названия в тексте выделены курсивом и, как правило, должны сопровождаться указаниями компетентных органов.
Включение авторитета позволяет избежать двусмысленности, которая может возникнуть, когда двум или более видам дано одно и то же название (только один из них, как правило, самый ранний, является действительным). Например, существует два понятия Festuca glauca: действительное название, описанное Вилларами, и имя, описанное Ламарком.
Родовое название может быть: 1) имя человека (память) (Linnaea - Linnaeus), название места (например, Arabis - Аравия), имя персонажа или аборигенное имя. Общее название дерева заканчивается на -us как дерево считается женским, например, Pinus, Quercus, Cedrus, Pyrus, Prunus и т.д. . По мнению МКБН, родовое название должно соответствовать следующему: 1) по мере возможности использовать латинское окончание, 2) избегать названий, не поддающихся адаптации к латинскому языку, 3) не делать слишком длинные и трудно произносимые имена, 4) не составлять названия путем объединения слов с разных языков, 5) указывать, если это возможно, путем образования или окончания названия родства или аналогий рода, 6) избегать прилагательных, используемых в качестве существительных, 7) не использовать название, аналогичное или производное от эпитета, во имя одного из видов рода; 8) не посвящать родов человеку, совершенно не связанному с ботаникой или, по крайней мере, с естественными науками; 9) давать женские формы всем личным родовым именам, независимо от того, напоминающим мужские или женские; 10) не создавать родовые имена путем объединения частей двух существующих родовых имен, поскольку такие названия могут быть смущены (B.) (не смешиваются)
Название вида растения основано на ботанической системе, популяризованной в 1753 году Каролином Линнеем. Научное название вида всегда состоит из двух частей (биноминальное выражение), первая - родовое название (обычно единственное и начинающееся с большой буквы), а вторая - видовой эпитет (начинающийся с маленькой буквы). Третий элемент - это имя человека, который официально дал это имя. Научное название вида также может быть Триномиальное (например, Orysa sativa subsp. Japonica) или Четырехчленное.
Для видов, которые были названы ранее в тексте, достаточно назвать вид, используя только первую букву генетического названия (Aegilops speltoides, Ae. speltoides). Для видов состоящего из двух слов, между двумя словами необходимо сделать дефис: Hibiscus rosa-sinensis).
Если конкретное имя неизвестно: Lathyrus sp. или Lathyrus spp. (если много видов). Научное название также принимается заглавным шрифтом и курсивом.
Исследователи растений, география, цветы и листья являются одними из основных ключей к пониманию названий растений. Эпитет вида может быть одним из следующих: 1) прилагательное, которое согласуется с родовым названием и указывает на отличительный характер вида или его происхождение, 2) существительное - это несогласие с родовым названием, но не обязательно с ним в роде (как в Pyrus malus), 3) существительное в роде, например, когда вид назван в честь одного или более лиц (как в Carex davisii, названном в честь г-на А. Керакса). Davis), и 4) общее название во множественном числе; обычно оно описывает что-то о среде обитания вида (как в Carex paludosum, означающем "болота"). Некоторые имена состоят из произвольной комбинации букв, если только они могут быть произносимыми. Это относится к группам, состоящим из большого количества видов (Winston, 1999). Согласно Уинстону, имя должно быть более одной буквы и не должно содержать диакритических знаков.
По мнению ICBN, конкретные эпитеты должны соответствовать следующему: по мере возможности использовать латинские термины, избегать эпитетов, которые очень длинные и трудно произносимые на латыни, не составлять эпитеты путем объединения слов с разных языков, избегать слов, образованных двумя или более дефинированными словами, избегать слов, имеющих то же значение, что и общее название (плеоназм), избегать тех, которые выражают характер, общий для всех или почти всех видов рода, избегать в одном роде тех, которые очень похожи, особенно тех, которые отличаются только последними буквами или расположением двух букв, избегать тех, которые использовались ранее в близкородственных родах, не принимать эпитеты из неопубликованных названий, найденное в переписке, заметках путешественников, гербарных этикетках или аналогичных источниках, с указанием их авторов, если только эти авторы не утвердили публикации, и избегать использования названий малоизвестных или очень ограниченных мест, если только вид не является достаточно местным.
Разнообразие и сорт, которые относятся к той или иной уникальной характеристике растения, появляются после конкретного эпитета (второй термин в научном названии). Название сорта может состоять из рода, за которым следуют "Эпитеты сорта Cultivar" или род и вид, за которым следуют "Эпитеты сорта Cultivar". Аббревиатуры "cv." или "var." больше недействительны . АКРА представила упрощенное руководство по наименованию новых сортов. Заглавное название культуры написано после букв cv. и не подчеркнуто и не выделено курсивом (например, Cercis Canadensis cv. Forest Pansy) или в пределах одной кавычки.