ОМР, как правило, управляются либо для многоцелевого, либо для зонального использования.
Управление для многоцелевого использования в значительной степени осуществляется на флагманском судне национальных морских заповедников США, а также в специальных природоохранных зонах, созданных в соответствии с Директивой Европейского Союза (ЕС) о средах обитания и видах.
Многократное использование ресурсов позволяет или в некоторых случаях пытается регулировать самые разнообразные виды использования, от судоходства и туристических судов до спортивного и коммерческого рыболовства, при "приемлемых" уровнях использования по всему охраняемому району моря. Конечно, некоторые виды использования могут быть полностью исключены, если они считаются слишком вредными, например, разведка нефти и газа, сброс отходов и некоторые виды пожаров.
Напротив, при зональном использовании или зонировании предпринимаются попытки создать зоны в местах и размерах, подходящих для одного или нескольких совместимых видов использования ресурсов, исключая при этом другие виды использования, но пытаясь охватить все или большинство видов использования в пределах нескольких зон, расположенных в пределах одного ОМР.
Разумеется, не каждый ОМР может справиться с любой задачей; многие из них слишком малы и лучше всего подходят для обеспечения высокого уровня защиты всей территории ОМР.
Управление множественным землепользованием имеет долгую историю на суше, со смешанными, часто плохими результатами, но охраняемые территории на суше успешно используют зональное использование в течение нескольких десятилетий, и это широко распространенная модель для многих национальных парков и охраняемых районов. Концепция биосферного заповедника предусматривает зонирование охраняемых территорий на суше, и она также была адаптирована для ОМР.
Биосферные заповедники имеют зональную архитектуру со значительными ключевыми ключевыми зонами, зарезервированными для строгой охраны, окружающими зонами для исследований, туризма, образования и других "легких" целей, а также другими зонами, открытыми для устойчивого использования морских ресурсов.
Особо охраняемые основные территории легко поддаются определению для морских млекопитающих, которые проводят время на лежбищах и лежбищах, а также с конусообразными ареалами обитания, например, для дельфинов или серых китов в местах зимнего размножения.
Но как насчет морских млекопитающих с менее четко определенной средой размножения или на кормовых площадках, подверженных в большей степени изменениям океанографических условий?
Одним из возможных решений могло бы стать закрытие районов, таких как лососевые или другие промыслы в различных частях мира, с возможностью адаптации по времени и территории.
Можно было бы использовать концепцию биосферного заповедника для создания крупных общих ОМР с рядом подвижных, высокоохраняемых "ключевых территорий", соответствующих критически важной среде обитания морских млекопитающих, границы которых можно было бы корректировать по мере необходимости. Такие корректировки будут постоянно пересматриваться и учитывать сезонные и годовые сигналы, поступающие из более широкой окружающей среды.
Однако для достижения такого мелкозернистого управления критически важной средой обитания необходимо попытаться понять экосистемные процессы и то воздействие, которое человек оказывает на эти процессы.