Дипломатические отношения между СССР и Пакистаном были установлены 1 мая 1948 г. Однако, отношения были между странами достаточно напряженными. Пакистан в 1955 г. вступил во враждебный для СССР блок СЕНТО. Состав блока: США, Великобритания, Турция, Иран, Ирак и Пакистан.
1 мая 1960 г. над СССР был сбит самолёт U-2 Локхид ВВС США. А вылетел он с авиабазы ВВС Пакистана под г. Пешавар. В связи с этим СССР выразил Пакистану резкий протест и пообещал в случае если это ещё раз повторится, то ВВС СССР разбомбят пакистанскую авиабазу.
Осложняли отношения между странами и индо-пакистанские войны 1947-1948 гг., 1965 г., 1971 г., в которых СССР поддерживал Индию. Особенно во время войны 1971 г. Ещё в 1964 г. между СССР и Индией было подписано соглашение о поставках в Индию истребителей МиГ-21, вертолетов Ми-4 и плавающих танков ПТ-76, в 1970 г. в Индии начался лицензионный выпуск МиГ-21. Учитывая, что боевые действия в 1971 г. шли в трудной местности, решающим фактором в победе индийских войск была высокая мобильность, которая была обеспечена плавающими танками ПТ-76 и транспортными вертолетами Ми-4, а благодаря самолетам МиГ-21 индийскими ВВС был выигран воздух. Всё это предопределило победу индийской армии. Более того, в победу Индии внес вклад ВМФ СССР, который в 1971 г. не позволил вмешаться в конфликт на стороне Пакистана эскадрам ВМФ США и Великобритании.
В 1978 г. президентом Пакистана стал генерал Мухаммед Зия-уль-Хак, который был идеологическим противником СССР.
В 1979 г. СССР ввел войска в Афганистан. Пакистан осудил это и начал оказывать помощь афганской исламской оппозиции, что и привело его фактически к войне с СССР в 1979-1989 гг.
В качестве лидеров исламской оппозиции в Афганистане в это время выдвинулись Г. Хекматьяр (позже сам М. Зия-уль-Хак признавался, что «именно Пакистан сделал Гульбеддина Хекматьяра афганским вождем») и Б. Раббани. Правительство Пакистана предоставило обоим убежище, а также занялось подготовкой и организацией их сторонников на базах межведомственной разведки Пакистана ISI в районе г. Пешавара, под руководством пакистанских инструкторов. Пешавар вскоре стал столицей афганской исламской оппозиции.
В Пакистане находилось 117 учебных центров и лагерей подготовки афганских боевиков. Численность обучающихся в этих лагерях одновременно составляла более 15.000 человек, а ежемесячный выпуск составлял 3.000 человек. Нередко боевики проходили обучение непосредственно в учебных центрах и частях пакистанской армии. Основными предметами обучения являлись: тактика, огневая подготовка, материальная часть оружия (стрелкового, минометов, гранатометов, артиллерии), рукопашный бой. В конце подготовки проводилось подведение итогов, определение уровня боевой подготовки выпускников с участием американских и пакистанских советников и инструкторов.
Большая роль отводилась Пакистану в поставках вооружения и боеприпасов афганским боевикам (только с 1984 г. по 1989 г. в Афганистан было направлено 3.784 каравана). Схема была такой: доставляло вооружение и боеприпасы в Пакистан и оплачивало издержки ЦРУ США. Затем ISI Пакистана принимала груз в Пакистане, складировало его и передавало афганским формированиям под Пешаваром. Много Пакистан сделал и для организации и ведения минной войны против советских войск в Афганистане.
На территории Пакистана содержались советские военнопленные в тюрьме Бадабер, а также афганские солдаты правительственной армии. 26 апреля 1985 г. 14 советских и 40 афганских военнопленных подняли восстание, в результате которого погибло около 200 афганских боевиков и пакистанских военнослужащих (в том числе 9 представителей пакистанских властей, 28 офицеров и 63 солдата 11-го армейского корпуса вооруженных сил Пакистана), а также 6 военных инструкторов США.
Происходили и бои регулярных советских и пакистанских войск.
- в августе 1980 г. советскими десантниками была уничтожена группа пакистанского спецназа численностью 30 человек;
- уничтожение 7 июня 1982 г. спецназом КГБ СССР 45 пакистанских солдат, экипированных в афганскую одежду;
- бой 7-8 января 1988 г. 9-й роты 345-го гвардейского отдельного парашютно-десантного полка ВДВ СССР против пакистанских спецназовцев из полка коммандос «Чинхатвал», в результате которого пакистанцы потеряли сотни убитыми.
Случались артиллерийские дуэли и бои ВВС СССР и Пакистана. В одном из воздушных боев 4 августа 1988 г. был сбит и взят в плен будущий вице-президент РФ Герой Советского Союза подполковник А. В. Руцкой. Освобождением А. В. Руцкого лично занимался руководитель Первого главного управления КГБ СССР (внешняя разведка) генерал армии В. А. Крючков. Уже 20 августа 1988 г. в Исламабаде А. В. Руцкой был обменян на арестованного в Москве пакистанского разведчика.
Проводил боевые операции советский спецназ в Пакистане.
Нужно отметить, что СССР поставлял вооружение и военную технику Индии. Например, вертолёты Ми-24 помогли одержать индийской армии в вооружённом конфликте с пакистанской армией в районе ледника Сиачен в 1987 г.
Шла борьба спецслужб СССР и Пакистана. Спецслужбы Пакистана формировали диверсионный аппарат, направленный против советских и афганских правительственных войск. Забрасывалась в Афганистан агентура (за годы войны только советские военные контрразведчики арестовали 62 агента иностранных государств (большая часть из которых агенты пакистанской разведки) и 915 агентов афганской исламской оппозиции, подготовкой которых занималась пакистанская разведка.
Также есть данные, что КГБ СССР ликвидировал президента Пакистана М. Зия-уль-Хака и 28 пакистанских чиновников и группу сотрудников Разведывательного управления Министерства обороны (РУМО) США во главе с бригадным генералом 17 августа 1988 г. Пакистанские спецслужбы напрямую связали эту акцию с деятельностью КГБ СССР в качестве кары за Бадабер. Этим объясняется сговорчивость Пакистана в обмене А. В. Руцкого.
Важную роль играл Пакистан в антисоветской и антиафганской пропаганде. На территории Пакистана действовало 8 радиостанций, в том числе «Голос Афганистана», «Би-Би-Си», «Голос Америки», «Радио Пакистан». Ежедневно выходило более 70 газет и журналов. Это газеты «Шахадат», «Моджахш», «Пайаме Афганистан», журналы «Шахид», «Рааде хуни».
Весной 1989 г., уже после ухода из Афганистана советских войск, афганской армией было отражено, с советской помощью широкомасштабное наступление, предпринятое объединенными силами афганской оппозиции при поддержке пакистанских воинских частей в районе города Джелалабад.
Однако в 1992 г. прекратилась помощь России афганскому правительству, которое скоро пало под натиском афганской исламской оппозиции. Но мира это не принесло ни Афганистану, ни Пакистану, ни впоследствии США. Но это, как говорится, уже другая история.
После вывода советских войск из Афганистана и распада СССР, отношения между РФ и Пакистаном значительно улучшились, особенно в последние годы. Но это тоже уже другая история.