Объём рода некоторых плодовых и ягодных культур разными ботаниками трактуется по-разному. В зарубежных странах в состав рода Prunus согласно системе Кэне включают все косточковые культуры кроме Prinsepia. Это создаёт большие неудобства, а иногда и путаницу, когда под родовым названием Prunus фигурирует миндаль, персик, слива, вишня, абрикос, черёмуха и т.д.
Отечественные ботаники и плодоводы придерживаются объёма рода Prunus по Миллеру, куда включают только виды сливы. В данной системе учитываются филогенетические связи между родами. Схематично эти связи принято изображать в виде генеалогического древа.
Согласно исследованиям Ерёмина Г.В. и Симагина В.С. был пересмотрен объём рода Cerasus.
Часть видов ранее относящихся к подроду Typocerasus были оставлены в Cerasus и разбиты на три секции Eucerasus, Ceradellus, Pseudocerasus. Остальные виды выделены в самостоятельный род - Padellus.
В секцию Eucerasus входит: черешня Cerasus avium ( по сист. Кэне Prunus avium).
В секцию Ceradellus входят:
Вишня обыкновенная Cerasus vulgaris (по сист. Кэне Prunus cerasus);
Вишня степная Cerasus fruticosa (по сист. Кэне Prunus fruticosa);
Вишня Маака Cerasus Maackii (по сист. Кэне Prunus Maackii) этот вид был исключён из рода черёмуха и перенесён в род вишня на основании исследований Ерёмина Г.В. и Симагина В.С. .
В секцию Pseudocerasus входят сакуры: вишня Саржента Cerasus sargentii (по сист. Кэне Prunus sargentii ); вишня остропильчатая Cerasus serrulata (по сист. Кэне Prunus serrulata); вишня сереющая Cerasus inscisa (по сист. Кэне Prunus inscisa); вишня сахалинская Cerasus sachalinensis (по сист. Кэне Prunus sachalinensis) и т.д.
Из подрода Typocerasus были выделены несколько видов в самостоятельный род –Padellus:
Вишня магалебская – теперь Паделлус магалебский Padellus machaleb (по сист. Кэне Prunus machaleb);
Вишня Максимовича – теперь Паделлус Максимовича Padellus Maximovitzii (по сист. Кэне Prunus Maximovitzii);
Вишня пенсильванская – теперь Паделлус пенсильванский Padellus pensilvanica (по сист. Кэне Prunus pensilvanica).
Весь подрод Microcerasus возведён в ранг самостоятельного рода Microcerasus .
В род Microcerasus входят виды:
Микровишня войлочная Microcerasus tomentosa (по сист. Кэне Prunus tomentosa);
Микровишня песчаная Microcerasus pumila (по сист. Кэне Prunus besseyi);
Микровишня железистая Microcerasus glandulosa (по сист. Кэне Prunus glandulosa) т.д.
Род Aflatunia был переименован в Louiseania без изменения видового состава.
Остальные рода косточковых остались без изменений.