Los organismos del suelo contribuyen al crecimiento de las plantas al propiciar la fertilidad del suelo. Es importante la micro flora puesto que se encarga de descomponer lo residuos orgánicos y con esto proveer nutrientes (nuestros abono caseros s ayudan en este proceso).
Algunos de los tipos de microorganismos son bacterias, hongos actinomicetos y algas. Estos microorganismos están presentes en el suelo cuando es saludable. Un centímetro cúbico de suelo puede contener por lo menos cinco billones de bacterias, un millón de hongos y veinte millones de actinomicetos y trescientas mil algas. Como se dijo estos microorganismos permiten descomponer la materia orgánica presente en el suelo provee nutrientes, fija el nitrógeno de la atmósfera.
Estos microorganismos se deben considerar no solamente por las funciones anteriores mencionadas. Además hay microorganismos que descomponen minerales como amonio, sulfuro y hierro al hacer esto permiten la nitrificación del suelo, que si es correcto contribuye a un sano crecimiento de nuestras plantas.
Las bacterias que fijan el nitrógeno cumplen un rol importante en el crecimiento de las plantas en cuanto a su altura dado que es capaz de convertir el nitrógeno atmosférico en formas aprovechables para el suelo. En las leguminosas, las raíces interactúan con las bacterias alimentándolas para que generen excreciones que sanean el nitrógeno del suelo. Muchas otras bacterias permiten un saneamiento del nitrógeno atmosférico