Чилийские внутриводные ракообразные характеризуются выраженным эндемизмом в различных пространственных масштабах: широко распространены виды, обитающие вдоль чилийской континентальной территории, а также существуют другие виды, ограниченные узкими географическими ареалами. Виды, демонстрирующие такой выраженный эндемизм, находятся под угрозой исчезновения в результате фрагментации среды обитания или изменения среды обитания, о чем сообщалось в более ранних исследованиях.
Географические особенности чилийских ракообразных, обитающих во внутренних водах, могут отражать неоднородность среды обитания. Так, основываясь на исследованиях ученых, которые использовали климатические, топографические и гидрологические характеристики, предложили следующие четыре региона в соответствии с зоогеографическим обзором внутриводных филлоподов и копеподов: Север Чили (18-27ºS); Центральный Чили (27-37ºS), Северная и Центральная Патагония (37º-51ºS) и Южная Патагония (51º-55ºS).
Как для филлоподов, так и для копеподов были обнаружены виды, которые ограничивались конкретным географическим ареалом, а также более распространенные виды. Учеными проводился зоогеографический анализ чилийских ракообразных, обитающих во внутренних водах (филлопода, копепода и малакострака) на континентальной территории Чили, с целью определения характера их распространения.
Данные о ракообразных, обитающих во внутренних водах, были проанализированы с учетом следующих категорий: 1) Все виды ракообразных, 2) Филлопод и Копепод и 3) Класс Малакострака.
На втором аналитическом этапе в матрицу присутствия-отсутствия видов была добавлена нулевая внешняя зона для кодификации укоренения пладограммы. Наиболее экономные пладограммы были выявлены при помощи эвристического поиска с 1000 репликами; реплики 100 исходных древ были использованы с выходом до 10000 древ и были рассчитаны с использованием повторяющейся бисекции. Строгое древо консенсуса было рассчитано на основе эвристического поиска. Поддержка узлов оценивалась методом бутстрап анализа. С помощью программ Нона и Винкладе были оценены значения поддержки бутстрапа (с 1000 реплик) для отдельных ветвей как областей эндемизма. Он был применен к одному анализу для понимания закономерностей эндемичности и сходства между изучаемыми областями.
Кластерный анализ показал, что для всех видов ракообразных, в том числе для филопода и копепода - существование основной группы, включает три патагонские зоны плюс Центральная Чили, отдельно от Северной и Северо-Центральной Чили.
Аналогичным образом, для класса малокострака анализ показал существование двух основных зон, одна из которых состоит из трех патагонских зон плюс Центральная Чили, а другая - северная и северо-центральная Чили. Анализ декаподов выявил изолированную основную группу, состоящую из очень схожих между собой северной и северо-центральной частей Чили и второй основной группы - центральной части Чили, включая Северную и Центральную Патагонию. Анализ амфипод выявил одну основную группу, включающую Центральную Чили с Северной и Центральной Патагонией, и она относительно схожа с Южной Патагонией. Эта группа отделена от обоих северных регионов Чили.
Для кладоцеранов существовал основной ареал Центральной Чили с Северной и Центральной Патагонией, а в порядке убывания сходства - Южной Патагонии, Северной и Северо-Центральной Чили. Наконец, для копеподов были обнаружены две основные группы (Центральная Чили - Северная Патагония и Центральная - Южная Патагония), которые отличаются от близко сходных северных и северо-центральных районов Чили. Анализ эндемичности парсимонии позволил получить эксклюзивную пладограмму со 111 ступенями, индекс согласованности которой 0,84 и индекс удержания 0,58. Полученные значения методом бутстрап колебались от 0,55 до 0,98 для различных областей эндемизма.
Результаты по всем видам ракообразных и группировании филлоподов и копеподов показали умеренную разницу между патагонскими видами и видами, обитающими в северных регионах, и согласуются с биогеографическим анализом копеподов Menu-Marque et al, которые выявили распространенные виды в сочетании с видами, имеющими очень ограниченное географическое распределение.
Одним из возможных факторов может быть высокая способность распространения филоподов и копеподов. Классы малакострака отличаются друг от друга: были обнаружены заметные различия между видами патагонских и северных видов в соответствии с биогеографическим анализом амфипод рода Hyalella и внутриводных декаподов. Аналогичная зоогеографическая картина наблюдалась и в роде Aegla. Это различие можно частично объяснить присутствием в Патагонии южноамериканских и субантарктических видов. Важным фактором здесь является то, что Южная Патагония имеет несколько субтропических видов в сочетании с субантарктическими видами, тогда как Север Чили является примером региона другой фауны.
Кроме того, в Чили горы Анды представляют собой барьер, который ограничивает или предотвращает распространение видов между двумя берегами гор и объясняет заметные различия в видах, зарегистрированных в зонах, включая Андские горы, по сравнению с Южной Патагонией, где горы практически исчезли и где можно найти много схожих видов. Следуя этому сценарию, можно объяснить заметные различия между видами, зарегистрированными в Западной и Восточной Южной Америке.