Вскоре после этого Щ.И.Т. отправил агента Джаспера Ситвелла к Тони, чтобы помочь руководить безопасностью Stark Industries и защищать интересы агентства в компании. Тони почувствовал его приход как угрозу, так как Ситвелл мог раскрыть его двойную личность. Ситуация еще больше осложнилась, когда Ситвелл и Тони влюбились в Уитни Фрост, но она оказалась дочерью врага Мстителей, графа Нефарии и члена иерархии преступного синдиката. Стремясь украсть изобретения Старка, Фрост послала против него своих агентов. Когда броня Тони начала выходить из строя, требуя немедленного ремонта, чтобы спасти его жизнь, Хэппи помог построить ее. Тони Старк также начал новый роман с Дженис Корд, отец которой умер во время ненавистью попытки убить Железного Человека.
Попытки Тони подать в отставку
После некоторых событий Тони попал в больницу с новым сердечным приступом. Ему убрали все осколки из груди и теперь он мог обходиться без магнита. Опасаясь нового приступа он попытался подать в отставку. Сразу после битвы с Люцифером, Тони предложил Эдварду Марчу, который когда-то был партнером Хэпии по тренировкам, чтобы он стал новым Железным Человеком. Сам Марч был очень рад предложению, но не сказал Тони о том, что у него в мозгу образовался тромб, способный вызвать его смерть в случае боя. Когда Марч сражался против последней версии Фиолетового Динамо он едва не погиб и Тони был вынужден одеть костюм, чтобы помочь ему. Как только он узнает о проблемах со здоровьем Марча, Старк отстраняет его от выполнения обязанностей Железного Человека.
Новые времена для компании
Тони начал отдалять свою компанию от производства оружия в новое русло. Подружившись с инженером Кевином О'Брайеном, Тони рассказал ему свой секрет. Затем он разработал вторую броню для О'Брайена, чтобы тот помогал в случае чрезвычайной ситуации. Однако, когда О'Брайен надел костюм, неисправность вызвала у инженера психическое расстройство, после которого он стал ненавидеть Железного Человека и вообще попытался начать роман с девушкой, с которой Тони раньше встречался. О'Брайен вступил в союз с Саймоном Гилбертом, акционером, который выступал против отказа Старка от рынка вооружений. Когда Железный Человек и О'Брайен сразились, Железный человек случайно убил его. Гилберт продолжил преследовать Старка вместе со своим сыном Гэри Гилбертом, преступным активистом. Но сестра Гэри, Роксана Гилберт, была влюблена в Тони и попыталась положить конец враждебности его семьи и Старка.
Поскольку его компания начала расширяться по всему миру, Тони переименовал компанию под названием Stark International. Став главным свидетелем того, как оружие, изготовленное его компанией, повлияло на невинные жизни, Тони решил полностью отказаться от него, а Stark International теперь работал в новой отрасли направленной на проектирование и производство электронных элементов и компьютерную инженерию. Майкл О'Брайен вскоре явился, чтобы обвинить Железного Человека в смерти своего брата Кевина, стремясь привлечь его к ответственности. Но в конце концов он признал героизм Железного Человека во время столкновения с Санфайром и простил ему смерть своего брата. Надев на себя новую версию доспехов брата, Майкл О'Брайен помог Железному Человеку против Мандарина, а некоторое время спустя также объединился с другими союзниками и друзьями Тони, чтобы помочь Железному Человеку против Мидаса. Железный человек взял под свое крыло.
Между тем, Щ.И.Т. был расстроен отказом Stark International от оружейной промышленности, что заставило их обратиться к новой компании для обеспечения новым оружием и техникой. Ник Фьюри приказал своим агентам попытаться захватить компанию Старка, но агенты потеряли контроль и вместо этого попытались убить Старка. Старк пережил нападение и был разочарован и зол на предательство со стороны Фьюри, к которому он на время потерял доверие.
Соперник Старка по имени Джастин Хаммер разработал устройство, которое дало ему удаленный контроль над броней Железного Человека и он начал тестировать его, создавая, казалось бы, случайные сбои. Хаммер, получил выгоду от своего устройства, когда Железный Человек присутствовал в качестве гостя на публичной церемонии Сергея Коцнина, где собирались подписать контракт с Stark International. Хаммер запустил устройство и один из репульсоров в костюме Железного Человека выстрелил в Коцнина, убив его на глазах у всех. Узнав, что Хаммер управлял его костюмом, Тони отправился на частный искусственный остров Хаммера, полный преступников, которые делали все что он скажет. Старк одержал победу над ними, а затем захватил одного из лучших ученых Джастина, чтобы он дал показания, для оправдания Тони, но Хаммер оставался вне закона.