Рассмотрим на примере Москвы. Ещё во времена СССР подумали о том, что будет удобно называть станции пересадок одинаково, но это в случае с кольцевой линией. Тогда уже существовали пересадочные узлы, но их станции именовались по разному. Но со временем решили что будет правильно переименовать некоторые станции, чтобы они имели уникальное название. Последняя открытая станция - Таганская была одноименная с кольцевой (кросс-платформенные не в счет).
В общем, здесь нет какого-то жесткого довода таких решений. Сначала подумали, что будет удобно так, а потом поняли что это имеет свои минусы и в итоге так получилось, что какие-то станции одноименные, а какие-то разные. Стоит учесть ещё то, что сами станции тоже неоднократно переименовывались. Например станция "Алексеевская" именовалась ранее как "Мир" и "Щербаковская", её соседка ВДНХ была "ВСХВ". Самые частые случаи смены названия произошли из-за "развенчания" культа Сталина и СССР.
Спасибо вам за прочтение этой небольшой статьи! Буду рад вашему лайку и подписке. О всех недочетах, предложениях, пожеланиях, вопросах пишите в комментариях. Жду вас в своих остальных статьях!