Противостояние ойратов и казахов в 17-18 веках принесло многие беды казахам и ойратам. Сейчас о той войне среди казахов принято говорить только как об освободительной. При этом не учитывается от факт, что ойраты и казахи длительное время (15-16 века) мирно сосуществовали. Да и в 20 веке калмаки (так называли ойратов казахи) мирно пасли скот вблизи от границ казахской степи, не вступая ни в какие стычки с казахами. Наоборот в 19 и 20 веках ойраты Западной Монголии принимали казахов, которые переселялись туда по различным причинам и сейчас казахи составляют значительную часть населения Баян-Олкинского автономного округа Монголии. То есть спокойно живут в Западной Монголии, основном ареале расселения ойратов.
В 15-16 веках ойраты и казак-узбеки даже вместе служили в войсках государства кочевых узбеков и в мангытских уделах. При этом ойраты занимали более привилегированное положение как монголы. Но не такое как мангыты, которые считались военной аристократией.
Открытое противостояние началось с Батура-хунтайджи (Эрдени Батур-хунтайджи) - основоположника Джунгарского ханства и его первого правителя (умер в 1653 году).
Батур-хунтайджи - выходец из рода Чорос как и его отец Хара-хулы мечтал о единоличной власти. Перед ним стоял образ великого Темуджина (Чингисхана), который смог объединить пассионарных монголов в единый кулак. Об этом скорее всего мечтал и амбициозный Батур-хунтайджи.
Для того, чтобы стать верховным правителем он в 1637 году с подчиненным ему племенем элёт участвовал в междоусобицах в Тибете между желтошапочниками (местный тибетский буддизм) и красношапочниками (тибетский буддизм с влиянием йогического учения из Индии).
В сражении против халхинских монголов, которые были союзниками красношапочников Батур под общим предводительством Гуши-хана (правитель хошутов) смог показать себя и получил титул хана из рук самого Далай-ламы. Также он получил новое имя Эрдэни (Драгоценность).
Между прочим именно в этом сражении элёты стояли на левом фланге и с тех пор их стали называть левофланговыми (джунгарами). В центре находились хошуты. На правом фланге стояли торгутские воины, в арьергарде находились дербеты и хойты.
С тех пор это построение стало основным и легло в основу Степного уложения, которое было принято всеми монголами в 1640 году. На курултае по случаю принятия Уложения Батур хунтайджи выступил с инициативой организовать военный союз против маньчжур, которые начали набирать силу. Монголы согласились на этом. Однако так как маньчжуры были заняты в Китае то Батур хунтайджи получив под свое начало 50 тысяч воинов начал наступление на казахов.
Ему удалось захватить Восточное Семиречье (территория от озера Балхаш до современной китайско-казахстанской границы). Но в 1643 году ему было нанесено сокрушительное поражение войсками казахского хана Салкама Жангира и бухарского эмира Жалантос Бахадура в Орбулакской битве.
Тут бы и добить бы его, но казахи не стали преследовать его, а втянулись в завоевательный поход против империи Великих Моголов в Афганистане. Они понадеялись, что союзные казахам хошоуты под предводительством Хунделен-тайши (был названным отцом Салкам Джангира - казахского хана) смогут разобраться с ослабленным Батуром.
Но человек полагает, а провидение располагает. И хошоуты, отправившие большую часть своих воинов в Тибет к Гуши-хану не справились с яростным Батур хунтайджи. Весной 1646 года в верховьях реки Каратал, впадающей в озеро Балхаш хошауты были разгромлены элётами Батура. Хошуты потеряли свое влияние среди ойратов и ушли на озеро Кукунор, где образовали отдельное государство. Вместе с хошутами закончилось время мира между казахами и ойратами.
В 1647 году Батур хонтайджи выступил против казахов и 17-летний ойратский багатур Голдама смог в бою пробиться к казахскому хану Салкаму и убил его. Казахи потерпели поражение и надолго потеряли возможности для наступления на Семиречье.
Окончательно покорив Семиречье Батур хунтайджи укрепил свою личную власть и перенес свою ставку в Кульджу (современный Или-Казахский автономный район Синьцзяна КНР). Именно отсюда он руководил государством Дурбан-Ойрот и набегами в казахские степи, владения монгольских алтан-ханов и Тибет.
Так началась бестолковая 100 летняя война между казахами и ойратами.