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Comment la thérapie antibiotique affecte les bactéries intestinales

Le traitement par antibiotique ciprofloxacine affecte la flore intestinale normale plus que prévu

Stanford (États-Unis) - Les antibiotiques injectés ou avalés ne tuent pas que les agents pathogènes. Il est inévitable qu'ils s'attaquent également aux bactéries intestinales bénéfiques. Dans quelle mesure cela se produit, les microbiologistes américains ont examiné plus en détail l'exemple de la ciprofloxacine. À l'aide de techniques de biologie moléculaire de pointe, ils ont pu montrer que la consommation d'antibiotique avait un effet négatif sur environ un tiers des germes intestinaux de tous types. Dans certains cas, même six mois après le traitement, la forte baisse du nombre de germes n'était pas revenue à la normale. La perturbation de l'équilibre entre les populations bactériennes dans le tube digestif sain peut avoir des effets graves et durables sur la santé, soulignent les chercheurs dans le journal en ligne "PLoS Biology".

Jusqu'à présent, on pensait que la ciprofloxacine avait peu d'effet sur les microbes de l'intestin - d'autant plus que les patients ne se plaignent généralement pas d'une altération de la fonction intestinale, écrivent les chercheurs à David Relman de l'Université de Stanford. En raison du nombre considérable d’espèces bactériennes présentes dans le côlon, il n’était pas possible lors d’études antérieures d’étudier l’ampleur de l’effet sur l’ensemble du spectre des germes. C’est le seul moyen d’activer la technique du pyroséquençage, qui permet d’analyser très rapidement de grandes quantités de parties spécifiques de gènes de gènes de 16SrRNA.

Les chercheurs ont traité trois sujets sains avec la ciprofloxacine, l’un des antibiotiques les plus utilisés. Comme avec une infection des voies urinaires, 500 milligrammes d'inhibiteur de la gyrase ont été administrés deux fois par jour pendant cinq jours. Avant, pendant et après le traitement, ils ont déterminé le contenu bactérien des échantillons de selles par analyse de l'ADN. Il s'est avéré que la thérapie réduisait considérablement le nombre de cellules de chaque troisième espèce de germe intestinal. Quatre semaines après la fin du traitement, la plupart des bactéries avaient à nouveau retrouvé leur taille initiale. Mais certaines des 5 700 espèces ont encore été décimées après six mois. Bien sûr, aucun des sujets ne s'est plaint de problèmes intestinaux après avoir terminé cette étude. L'étendue des effets secondaires est individuellement très différente. Selon le type d'antibiotique et la durée du traitement, celui-ci peut entraîner des allergies, des infections fongiques, des diarrhées ou même des maladies intestinales chroniques telles que la colite pseudo-membraneuse.