Добры дзень! Вы па тэхналогіі, дзякуй за чытанне! Кожны станоўчы і добры каментар грэе маю душу!
Артыкул суб'ектыўны і выражае асабістае меркаванне аўтара.
З паспяваннем вялікіх дадзеных, паслядоўнасцю цэлага генома і іншымі экспансіўнымі даследаваннямі часам бывае адчуванне, што даследчыкі гандлююць у сваіх мікраскопах на мікраскопы. Але конкурс на топ-10 інавацый у гэтым годзе распавядае пра іншую гісторыю: пра адну клетку.
Шмат цікавых лабараторных інструментаў, якія наша незалежная судзейская калегія (біяграфічныя дадзеныя і каментарыі да кожнай з лепшых 10 прадуктаў, якія вы знойдзеце ніжэй), выбраныя для ўраджаю гэтага года, накіравана на вылучэнне адкрытых асобных клетак для доступу да дадзеных, якія змяшчаюцца ў іх ДНК, РНК і / або бялкі. Перавагай збору гэтых пучкоў біялагічнай інфармацыі на ўзроўні адной клеткі з'яўляецца выяўленне разнастайнасці ў тканінах, якія не выяўляюцца ў аб'яднаных узорах. Напрыклад, у даследаваннях на рак такія аналізы могуць дазволіць навукоўцам больш дакладна ахарактарызаваць неаднастайнасць пухліны шляхам адбору пробаў некалькіх тысяч клетак, якія хутка дзеляцца, на асобнай аснове, каб даведацца, чым яны адрозніваюцца адзін ад аднаго.
Таксама ў гэтым спісе наглядныя вырабы - гэта прадукты, якія дазваляюць апрабаваць і выпрабаваць сапраўдныя лабараторныя тэхналогіі, такія як масавая спектраметрыя і рэдагаванне геному на аснове CRISPR. Мы ў The Scientist рады прадставіць пераможцаў нашага конкурсу Top 10 Innovations 2018, і мы з нецярпеннем чакаем адкрыцця, якое квітнее з моманту іх прыняцця.
Сферы вадкасці • Cyto-Mine
Каля пяці гадоў таму супрацоўнікі Sphere Fluidics спыталі ў 35 біяфармацэўтычных кампаній, ці можа аднакалейная тэхналогія аналізу біятэхнічнай кампаніі ў Вялікабрытаніі прынесці карысць. У адказах адзначалася неабходнасць, асабліва сярод кампаній, якія працуюць на антыцелы і клеткавыя лініі. З гэтых размоваў выйшла Cyto-Mine, кампактны настольны апарат, які займае месца таго, што звычайна можна выканаць з дапамогай некалькіх інструментаў. "Гэта, па сутнасці, першае ў свеце інтэграванае прылада, спецыяльна распрацаванае для аўтаматычнага выканання ўсіх этапаў адкрыцця антыцелаў і рабочых працэсаў развіцця клеткавай лініі", - кажа Роб Мармонт, дырэктар па продажах і маркетынгу ў Sphere Fluidics, які пачаў прадаваць інструмент гэтым летам.
Cyto-Mine экраніруе ўзор да 200 000 клетак, сартаваўшы іх па асобнасці ў свае малюсенькія кроплі, ацэньваючы іх па жаданай уласцівасці (напрыклад, высокай выпрацоўцы пэўнага бялку або спецыфічнасці антыгена), а затым размяркоўвае добрыя на мікрацітравыя пласціны. , з якога карыстальнікі могуць вырасціць клоны.
Том Келі, навуковец фармацэўтычнай кампаніі Janssen, быў раннім выпрабавальнікам Cyto-Mine і зараз выкарыстоўвае дапрацаваную версію (па кошце 450 000 долараў) для выбару клеткавых ліній, якія вырабляюць вялікую колькасць біялагічнага прэпарата. Ён лічыць, што самай вялікай перавагай з'яўляецца доказ клональнасці, які Cyto-Mine пастаўляе, што пацвярджае, што ў кожнай свідравіне ёсць толькі адна правераная ячэйка. Яго папярэдні пратакол уключаў дадатковы крок, які падвоіў час апрацоўкі. "Час, які неабходны для пераходу ад заражэння да замарожвання ампул па старым працэсе, складаў бы тры месяцы", - кажа ён, - і зараз прайшло шэсць тыдняў.
KOEHLER: "Мы часта змагаемся за тое, каб знайсці адзіную інтэграваную платформу, якая б забяспечвала як скрынінг, так і аднаўленне клетак для аналізу паслядоўна. Поўная аўтаматызацыя і сістэма, арыентаваная на далікатныя маніпуляцыі, павысяць вернасць эксперыментаў ".
Місія Bio • Платформа Precision Precision Genomics
Платформа Tapestri Precision Genomics, запушчаная ў снежні мінулага года, стала першым высокапрапускным інструментам для падрыхтоўкі ўзору аднаклеткавай паслядоўнасці ДНК. Выкарыстоўваючы тэхналогію мікрафлюідыкі на аснове кропель, Tapestri спачатку падвяргае клеткі пратэазе, якая лізіруе ядро і вызваляе ДНК ад адукацыі кандэнсаванага храмаціну. Затым цяпла дэнатурацыі, якія пратэазуюць перад сістэмай, дадаюць рэагенты для ўзмацнення цікавых локусаў і штрыхкода іх у адпаведнасці з клеткамі іх паходжання, рыхтуючы ўзоры для паступлення ў секвенсар наступнага пакалення.
"Гэта захапляльна", - кажа генетык доктара медыцынскіх навук Андэрсан Нік Навін, група якога рэгулярна карыстаецца інструментам каля года, каб выявіць спалучэнні мутацый, выяўленых у асобных клетках рака малочнай залозы. "Гэта дазваляе сапраўды зразумець генетычную структуру пухліны", - кажа ён, а таксама "аднавіць эвалюцыю мутацый".
Габелены могуць нарыхтаваць да 10 000 клетак адначасова, у параўнанні з толькі 384 пры сартаванні клетак у лункі. Больш за тое, кажа Навін, для падрыхтоўкі пробы патрабуецца ўсяго каля сутак у параўнанні з пяць-сем дзён з выкарыстаннем пласцінавага метаду.
Кошт габелена - 79 500 долараў, а расходныя матэрыялы - каля 795 да 1300 долараў за ўзор. Mission Bio прапануе некалькі фіксаваных панэляў, арыентаваных на локусы, якія тычацца розных відаў раку, і можа распрацаваць індывідуальныя панэлі, якія арыентуюцца на 300 локусаў, якія прадстаўляюць інтарэс, і, магчыма, больш у будучыні, пашыраючы прыкладанні Tapestri за межамі анкалогіі, кажа Дэніс Істберн, галоўны навуковы супрацоўнік Mission Бія.
УІЛІ: "Гэтая новая мікрафлюідальная платформа для высокапрапускнай аднаклеткавай секвенцыі ДНК можа стаць магутным падыходам для аналізу неаднастайнасці опухолевых клетак і разумення механістычнай асновы эвалюцыі пухліны".
Калі вам, сябры, спадабалася, буду рады, калі вы націснеце «падпісацца»! Акрамя таго, не забывайце пра свае каралеўскія падобныя і шчырыя каментарыі пад гэтым артыкулам. Дзякуй за ўвагу!