Жуан Феликс является воспитанником «Бенфики», вместе с молодёжной командой становился финалистом Юношеской Лиги УЕФА. В детстве в течение семи лет тренировался в академии «Порту», однако был отпущен в связи со слабыми физическими данными.
С начала сезона 2018/19 тренировался с основной командой «Бенфики». 18 августа 2018 года дебютировал в чемпионате Португалии, выйдя на замену, и уже 25 августа забил свой первый гол за «Бенфику» в матче чемпионата против «Спортинга», став самым молодым автором гола в лиссабонском дерби. 11 апреля 2019 года в четвертьфинальном Лиги Европы против Айнтрахта забил три мяча, став самым молодым автором хет-трика в истории турнира. Всего в сезоне 18/19 Феликс забил за «Бенфику» 20 мячей.
3 июля 2019 года перешёл в испанский клуб «Атлетико Мадрид», который заплатит за его переход 126 млн евро, побив трансферную стоимость своего соотечественника - Криштиану Роналду.
Жоау Фелиш выделяется своим дриблингом и скоростными данными, также при росте 180 сантиметров неплохо играет на втором этаже. На поле он ведёт себя смело и раскованно, старается сохранять мяч даже в сложных ситуациях.
Что же думает Криштиану о своём преемнике? Сможет ли он повторить его успех?
форвард туринского «Ювентуса» Криштиану Роналду заявил, что верит в новичка мадридского «Атлетико» Жоау Фелиша.
— Верю ли я, что Фелиш сможет повторить мои успех в Испании? Конечно, как и в него самого. Он отличный игрок с большим потенциалом, и ему еще есть что показать, — сказал Роналду.